Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Krtap1-3A2A588 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Krtap1-3A2A588 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krtap1-3A2A588 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms