Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cul4bA2A432 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cul4bA2A432 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cul4bA2A432 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cul4bA2A432 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cul4bA2A432 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cul4bA2A432 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cul4bA2A432 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cul4bA2A432 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cul4bA2A432 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cul4bA2A432 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cul4bA2A432 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cul4bA2A432 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cul4bA2A432 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cul4bA2A432 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cul4bA2A432 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cul4bA2A432 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cul4bA2A432 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cul4bA2A432 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cul4bA2A432 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul4bA2A432 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul4bA2A432 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul4bA2A432 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cul4bA2A432 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cul4bA2A432 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cul4bA2A432 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cul4bA2A432 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cul4bA2A432 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cul4bA2A432 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cul4bA2A432 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cul4bA2A432 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cul4bA2A432 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cul4bA2A432 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cul4bA2A432 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cul4bA2A432 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cul4bA2A432 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cul4bA2A432 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cul4bA2A432 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cul4bA2A432 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cul4bA2A432 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cul4bA2A432 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cul4bA2A432 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cul4bA2A432 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cul4bA2A432 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cul4bA2A432 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cul4bA2A432 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms