Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp1bA1Z198 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp1bA1Z198 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp1bA1Z198 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp1bA1Z198 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp1bA1Z198 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1bA1Z198 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1bA1Z198 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1bA1Z198 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1bA1Z198 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1bA1Z198 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1bA1Z198 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp1bA1Z198 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp1bA1Z198 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp1bA1Z198 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp1bA1Z198 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp1bA1Z198 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp1bA1Z198 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp1bA1Z198 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp1bA1Z198 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms