Protein–RNA interactions for Protein: A1L317

Krt24, Keratin, type I cytoskeletal 24, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt24A1L317 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Krt24A1L317 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Krt24A1L317 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Krt24A1L317 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Krt24A1L317 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Krt24A1L317 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Krt24A1L317 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Krt24A1L317 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Krt24A1L317 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Krt24A1L317 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Krt24A1L317 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Krt24A1L317 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt24A1L317 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt24A1L317 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Krt24A1L317 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Krt24A1L317 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Krt24A1L317 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Krt24A1L317 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Krt24A1L317 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Krt24A1L317 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Krt24A1L317 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms