Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trav12-2A0N8N6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trav12-2A0N8N6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trav12-2A0N8N6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms