Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVU1

Gm7298, Predicted gene 7298, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7298A0A0N4SVU1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Gm7298A0A0N4SVU1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Gm7298A0A0N4SVU1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Gm7298A0A0N4SVU1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Gm7298A0A0N4SVU1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Gm7298A0A0N4SVU1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Gm7298A0A0N4SVU1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Gm7298A0A0N4SVU1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Gm7298A0A0N4SVU1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Gm7298A0A0N4SVU1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Gm7298A0A0N4SVU1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Gm7298A0A0N4SVU1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Gm7298A0A0N4SVU1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Gm7298A0A0N4SVU1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Gm7298A0A0N4SVU1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Gm7298A0A0N4SVU1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Gm7298A0A0N4SVU1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Gm7298A0A0N4SVU1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Gm7298A0A0N4SVU1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Gm7298A0A0N4SVU1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Gm7298A0A0N4SVU1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Gm7298A0A0N4SVU1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Gm7298A0A0N4SVU1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Gm7298A0A0N4SVU1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Gm7298A0A0N4SVU1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Gm7298A0A0N4SVU1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Gm7298A0A0N4SVU1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Gm7298A0A0N4SVU1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Gm7298A0A0N4SVU1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Gm7298A0A0N4SVU1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Gm7298A0A0N4SVU1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Gm7298A0A0N4SVU1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Gm7298A0A0N4SVU1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Gm7298A0A0N4SVU1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Gm7298A0A0N4SVU1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Gm7298A0A0N4SVU1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Gm7298A0A0N4SVU1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Gm7298A0A0N4SVU1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Gm7298A0A0N4SVU1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Gm7298A0A0N4SVU1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Gm7298A0A0N4SVU1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Gm7298A0A0N4SVU1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Gm7298A0A0N4SVU1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Gm7298A0A0N4SVU1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Gm7298A0A0N4SVU1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Gm7298A0A0N4SVU1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Gm7298A0A0N4SVU1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Gm7298A0A0N4SVU1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Gm7298A0A0N4SVU1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Gm7298A0A0N4SVU1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Gm7298A0A0N4SVU1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Gm7298A0A0N4SVU1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Gm7298A0A0N4SVU1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Gm7298A0A0N4SVU1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Gm7298A0A0N4SVU1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Gm7298A0A0N4SVU1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Gm7298A0A0N4SVU1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Gm7298A0A0N4SVU1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Gm7298A0A0N4SVU1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Gm7298A0A0N4SVU1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Gm7298A0A0N4SVU1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Gm7298A0A0N4SVU1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Gm7298A0A0N4SVU1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Gm7298A0A0N4SVU1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Gm7298A0A0N4SVU1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Gm7298A0A0N4SVU1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Gm7298A0A0N4SVU1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Gm7298A0A0N4SVU1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Gm7298A0A0N4SVU1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Gm7298A0A0N4SVU1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Gm7298A0A0N4SVU1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Gm7298A0A0N4SVU1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Gm7298A0A0N4SVU1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Gm7298A0A0N4SVU1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Gm7298A0A0N4SVU1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Gm7298A0A0N4SVU1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Gm7298A0A0N4SVU1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Gm7298A0A0N4SVU1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Gm7298A0A0N4SVU1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Gm7298A0A0N4SVU1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
Gm7298A0A0N4SVU1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Gm7298A0A0N4SVU1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms