Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
1700019A02RikA0A087WPV9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
1700019A02RikA0A087WPV9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
1700019A02RikA0A087WPV9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
1700019A02RikA0A087WPV9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
1700019A02RikA0A087WPV9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
1700019A02RikA0A087WPV9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
1700019A02RikA0A087WPV9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
1700019A02RikA0A087WPV9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
1700019A02RikA0A087WPV9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
1700019A02RikA0A087WPV9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
1700019A02RikA0A087WPV9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
1700019A02RikA0A087WPV9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
1700019A02RikA0A087WPV9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
1700019A02RikA0A087WPV9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
1700019A02RikA0A087WPV9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms