RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628742.2

SOX9-AS1-218, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 733 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LMAN1P49257 510 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TNFSF10P50591 281 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 WNT3AP56704 352 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PRKAA1Q13131 559 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 XRCC4Q13426 336 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KRT81Q14533 505 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PDK1Q15118 436 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TCEAL1Q15170 157 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SLC1A5Q15758 541 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ASIC2Q16515 512 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NKG7Q16617 165 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HIF1AQ16665 826 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HADHQ16836 314 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ATG9BQ674R7 924 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SARM1Q6SZW1 724 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ISLR2Q6UXK2 745 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RANBP10Q6VN20 620 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HEXDCQ8WVB3 486 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LCN9Q8WX39 176 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RAPGEF5Q92565 580 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 BTBD6Q96KE9 485 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FCRL5Q96RD9 977 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FICDQ9BVA6 458 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SRMSQ9H3Y6 488 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OLAHQ9NV23 265 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TRIM10Q9UDY6 481 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ICKQ9UPZ9 632 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CDYLQ9Y232 598 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 JMJD1CQ15652 2540 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 A0A1B0GX78 115 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CCDC78A2IDD5 438 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MASP2O00187 686 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SRP72O76094 671 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KLHL18O94889 574 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PRAMEF1O95521 474 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CTSBP07858 339 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PVRP15151 417 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 UGT2B7P16662 529 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HTR1EP28566 365 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GLRBP48167 497 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KLHL30Q0D2K2 578 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MPP3Q13368 585 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FAM151BQ6UXP7 276 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DAAM2Q86T65 1068 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FJX1Q86VR8 437 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GPR135Q8IZ08 494 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NXPE1Q8N323 547 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KCTD6Q8NC69 237 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DNAJB14Q8TBM8 379 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF398Q8TD17 642 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TTC25Q96NG3 672 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 VAT1Q99536 393 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NRTNQ99748 197 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 COG4Q9H9E3 785 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 BPIFA1Q9NP55 256 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 A0A0J9YY10 115 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GSAPA4D1B5 854 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-218ENST00000628742 C5orf60A6NFR6 353 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms