RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 RAET1GQ6H3X3 334 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 BNIPLQ7Z465 357 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 D2HGDHQ8N465 521 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 FAM13CQ8NE31 585 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 ZNF398Q8TD17 642 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 CKAP2Q8WWK9 683 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 SPOCK2Q92563 424 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 HAUS1Q96CS2 278 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 ZDHHC12Q96GR4 267 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 FAM81BQ96LP2 452 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 RUNDC3BQ96NL0 473 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 NLRC4Q9NPP4 1024 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 NMRK1Q9NWW6 199 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 KCTD5Q9NXV2 234 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 ABI3Q9P2A4 366 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 KCNN3Q9UGI6 736 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 KCNK6Q9Y257 313 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 STK38LQ9Y2H1 464 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 MEMO1Q9Y316 297 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 SEC16AO15027 2179 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 SONP18583 2426 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ESYT3A0FGR9 886 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 A8MUI8 341 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 FOXO6A8MYZ6 492 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SLCO2B1O94956 709 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 F12P00748 615 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 AMD1P17707 334 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 XIAPP98170 497 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SLC34A1Q06495 639 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 DPTQ07507 201 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 TFF3Q07654 80 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 DSG2Q14126 1118 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 RCN2Q14257 317 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SSPNQ14714 243 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 RPS6KA1Q15418 735 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ZNF789Q5FWF6 425 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 DENND2CQ68D51 928 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 TTI2Q6NXR4 508 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 KMT5CQ86Y97 462 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 FITM2Q8N6M3 262 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 OR8K5Q8NH50 307 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 COX14Q96I36 57 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ZNF559Q9BR84 538 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 DHRS4Q9BTZ2 278 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 RETREG1Q9H6L5 497 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ETNK1Q9HBU6 452 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ZNF835Q9Y2P0 537 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ACTL7BQ9Y614 415 aa11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 A8MX80 341 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 MAP3K7O43318 606 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 LYNP07948 512 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 RHOQP17081 205 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 LHCGRP22888 699 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 HOXC12P31275 282 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SLC19A1P41440 591 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 RGRP47804 291 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 GPR19Q15760 415 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 RGS9BPQ6ZS82 235 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CATSPER1Q8NEC5 780 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 OR2W6PQ8NHA6 318 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 NAT14Q8WUY8 206 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CPT1BQ92523 772 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 COX4I2Q96KJ9 171 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 MAGEB18Q96M61 343 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 FMO2Q99518 471 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SELENOSQ9BQE4 189 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 TMEM165Q9HC07 324 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SEC14L3Q9UDX4 400 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 INTUQ9ULD6 942 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CNTN6Q9UQ52 1028 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms