RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589934.1

APBA3-204, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-204	ENST00000589934	BPGM	P07738	259 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	SLC2A4	P14672	509 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	CYP2A7	P20853	494 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	NDUFS1	P28331	727 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	ALDH3A1	P30838	453 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	SLC6A12	P48065	614 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	DNAJB13	P59910	316 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	NHLH1	Q02575	133 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	TAP2	Q03519	686 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	PRKG2	Q13237	762 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	GPR18	Q14330	331 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	NR1D2	Q14995	579 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	PROX2	Q3B8N5	592 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	ARL10	Q8N8L6	244 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	OR56A3	Q8NH54	315 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	SCYL1	Q96KG9	808 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	MECR	Q9BV79	373 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	POLG2	Q9UHN1	485 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		12.82	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	SYCE1L	A8MT33	242 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	STX16	O14662	325 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	BIRC5	O15392	142 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	GUCA1C	O95843	209 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	RPN2	P04844	631 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	MYF5	P13349	255 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	CHN1	P15882	459 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	EPOR	P19235	508 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	KCNA4	P22459	653 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	PKLR	P30613	574 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	ARRB2	P32121	409 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	AGTR2	P50052	363 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	GPS2	Q13227	327 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	SLC14A1	Q13336	389 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	SETDB1	Q15047	1291 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	MAPK15	Q8TD08	544 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	MOCOS	Q96EN8	888 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	APOLD1	Q96LR9	279 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	IL17F	Q96PD4	163 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	HGH1	Q9BTY7	390 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	SGPP1	Q9BX95	441 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	ARL15	Q9NXU5	204 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	OGFR	Q9NZT2	677 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	TMCO1	Q9UM00	188 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	CBFA2T3	O75081	653 aa		12.8	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	VIP	P01282	170 aa		12.8	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	ANXA5	P08758	320 aa		12.8	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	IMPDH1	P20839	514 aa		12.8	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	HNMT	P50135	292 aa		12.8	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	RAB28	P51157	221 aa		12.8	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	HHEX	Q03014	270 aa		12.8	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	PFKFB4	Q16877	469 aa		12.8	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	UNC50	Q53HI1	259 aa		12.8	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		12.8	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
APBA3-204	ENST00000589934	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		12.8	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms