RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 MYBPC3Q14896 1274 aa14.96□□□□□ -0.01
NME3-211ENST00000568561 SPA17Q15506 151 aa14.96□□□□□ -0.01
NME3-211ENST00000568561 SYTL3Q4VX76 610 aa14.96□□□□□ -0.01
NME3-211ENST00000568561 CCDC38Q502W7 563 aa14.96□□□□□ -0.01
NME3-211ENST00000568561 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.96□□□□□ -0.01
NME3-211ENST00000568561 KCTD11Q693B1 232 aa14.96□□□□□ -0.01
NME3-211ENST00000568561 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
NME3-211ENST00000568561 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.96□□□□□ -0.01
NME3-211ENST00000568561 OR2Y1Q8NGV0 311 aa14.96□□□□□ -0.01
NME3-211ENST00000568561 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
NME3-211ENST00000568561 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.96□□□□□ -0.01
NME3-211ENST00000568561 TSPY26PQ9H489 355 aa14.96□□□□□ -0.01
NME3-211ENST00000568561 TXLNGQ9NUQ3 528 aa14.96□□□□□ -0.01
NME3-211ENST00000568561 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.96□□□□□ -0.01
NME3-211ENST00000568561 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
NME3-211ENST00000568561 CSAG2Q9Y5P2 127 aa14.96□□□□□ -0.01
NME3-211ENST00000568561 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa14.96□□□□□ -0.01
NME3-211ENST00000568561 ISM1B1AKI9 464 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 AP2A2O94973 939 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 ALPPP05187 535 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 DCTP40126 519 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 GDF10P55107 478 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 RWDD2BP57060 319 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 IP6K3Q96PC2 410 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 C19orf43Q9BQ61 176 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 SLC22A11Q9NSA0 550 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 CCDC162PA2VCL2 907 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 ANKUB1A6NFN9 424 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 SOWAHDA6NJG2 315 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 OR1I1O60431 355 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 FTH1P02794 183 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 ITGAXP20702 1163 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 MAGP20916 626 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 FOXN2P32314 431 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 NSG1P42857 185 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 CYP2A13Q16696 494 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 CUZD1Q86UP6 607 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 TBC1D21Q8IYX1 336 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 LRRC45Q96CN5 670 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 AP1M1Q9BXS5 423 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 LRRC40Q9H9A6 602 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 OR6C2Q9NZP2 312 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 SRPK3Q9UPE1 567 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 TJP3O95049 919 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 GSTM1P09488 218 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 ALAS2P22557 587 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 ITGA3P26006 1051 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 GLRBP48167 497 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 GSTM4Q03013 218 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 ITIH4Q14624 930 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 HIF1AQ16665 826 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 PARP6Q2NL67 630 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 IGFL3Q6UXB1 125 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 TTLL10Q6ZVT0 673 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 STYXQ8WUJ0 223 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 PTERQ96BW5 349 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 C5orf34Q96MH7 638 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 IL17FQ96PD4 163 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 NDC1Q9BTX1 674 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 SLC6A20Q9NP91 592 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 EURLQ9NYK6 297 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 POLG2Q9UHN1 485 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 CSMD1Q96PZ7 3565 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-211ENST00000568561 WIPF3A6NGB9 483 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms