RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 CLCN4P51793 760 aa8.34□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 NPY6RQ99463 290 aa8.34□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 SNX33Q8WV41 574 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 XAGE5Q8WWM1 108 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 KCNJ9Q92806 393 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 UFD1Q92890 307 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 NPAS2Q99743 824 aa8.33□□□□□ -1.08
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