RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	WDR54	Q9H977	334 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	EURL	Q9NYK6	297 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	ABI3	Q9P2A4	366 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	AKAP6	Q13023	2319 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	AGAP14	A8MT82	685 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	MYO1F	O00160	1098 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	MAP3K7	O43318	606 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	SLC19A2	O60779	497 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	CLDN14	O95500	239 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	ALB	P02768	609 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	PRSS56	P0CW18	603 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	NFKB1	P19838	968 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	ART1	P52961	327 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	OLIG2	Q13516	323 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	ITGA9	Q13797	1035 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	SLC1A5	Q15758	541 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	ATG9B	Q674R7	924 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	SARM1	Q6SZW1	724 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	ASB8	Q9H765	288 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557		A0A087X0T9	212 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557		A0A0J9YY10	115 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1B0GX78	115 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	CCL22	O00626	93 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	PROSC	O94903	275 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	WDPCP	O95876	746 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	AGT	P01019	485 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	EPO	P01588	193 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	FAM228B	P0C875	321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	PRR35	P0CG20	571 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	CD99	P14209	185 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	AGA	P20933	346 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	GRIA3	P42263	894 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	RBBP7	Q16576	425 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	ADAM10	O14672	748 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	HP	P00738	406 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	COX6A1	P12074	109 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	CD1E	P15812	388 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	MAG	P20916	626 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	ACADL	P28330	430 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	CD151	P48509	253 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	EFNA3	P52797	238 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	KLC1	Q07866	573 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	MTFR2	Q6P444	385 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	IPMK	Q8NFU5	416 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	CUTC	Q9NTM9	273 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	MEMO1	Q9Y316	297 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	PKP3	Q9Y446	797 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	ABCA4	P78363	2273 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	DYTN	A2CJ06	578 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	KLHL33	A6NCF5	533 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	DSCR3	O14972	297 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	RASAL1	O95294	804 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	PYGM	P11217	842 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	MYL5	Q02045	173 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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