RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC73Q5JTD7 316 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 PDSS1Q5T2R2 415 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00696Q6ZRV3 163 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 CRYBG2Q8N1P7 616 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 VPS18Q9P253 973 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PPI3 338 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SLC30A4O14863 429 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 PGLSO95336 258 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 BAG4O95429 457 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM18P0DKX4 95 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 T-ENOLP0DO92 83 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V1B1P15313 513 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 PTGER4P35408 488 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 FUT6P51993 359 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 UBASH3AP57075 661 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 NFE2L1Q14494 772 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 KIR2DS3Q14952 304 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 HOOK3Q86VS8 718 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 FAM219AQ8IW50 185 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 THAP8Q8NA92 274 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 OR13J1Q8NGT2 312 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 HEXDCQ8WVB3 486 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 IRGQQ8WZA9 623 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 RAD54LQ92698 747 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 IGSF21Q96ID5 467 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 IL17FQ96PD4 163 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 FUT8Q9BYC5 575 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 PANK2Q9BZ23 570 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SPHK1Q9NYA1 384 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 MTRRQ9UBK8 725 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ITGA11Q9UKX5 1188 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 C5orf52A6NGY3 159 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 E9PI62 339 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 FAM86B1E9PN63 330 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 FAM86B2P0C5J1 330 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 TCF4P15884 667 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 WNT5AP41221 380 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ALDH3A2P51648 485 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 THOP1P52888 689 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 MBTD1Q05BQ5 628 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 NADSYN1Q6IA69 706 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 FIBINQ8TAL6 211 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA33Q96N06 139 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 MIS12Q9H081 205 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 MTUS1Q9ULD2 1270 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 PCSK5Q92824 1860 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 A4D1N5 150 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 INSIG1O15503 277 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 CTSVO60911 334 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV4-39P01824 125 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SPP1P10451 314 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 IRF2P14316 349 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ZXDBP98169 803 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 TNK1Q13470 666 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 VEZF1Q14119 521 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 MORF4L2Q15014 288 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 NPTX1Q15818 432 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SIRPB2Q5JXA9 342 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 STXBP5Q5T5C0 1151 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 NOTUMQ6P988 496 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 GPATCH11Q8N954 259 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf77Q96MU5 243 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 MYADMQ96S97 322 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 MEIS3Q99687 375 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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