RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458646.1

RARB-204, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARB, Length 2,590 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-204ENST00000458646 MYO1DO94832 1006 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 KCNK2O95069 426 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 SEC24AO95486 1093 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 OTCP00480 354 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 LCKP06239 509 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 HMBSP08397 361 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 SLC2A4P14672 509 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 SERPINB10P48595 397 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 GSSP48637 474 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 HSPA7P48741 367 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 TTPAP49638 278 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 CPT1AP50416 773 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 CLCN4P51793 760 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 PPP5CP53041 499 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 CXCR4P61073 352 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 FADDQ13158 208 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 SNX20Q7Z614 316 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 LACC1Q8IV20 430 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 THEM5Q8N1Q8 247 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 SETD9Q8NE22 299 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 CLHC1Q8NHS4 586 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 GPR152Q8TDT2 470 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 APH1BQ8WW43 257 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 ZBTB18Q99592 522 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 PITX2Q99697 317 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 MYOCQ99972 504 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 IPPKQ9H8X2 491 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 IL37Q9NZH6 218 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 OPTCQ9UBM4 332 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 KLHL3Q9UH77 587 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 H3BNC9 293 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 FFAR2O15552 330 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 ESR1P03372 595 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 NTRK1P04629 796 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 IL6P05231 212 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 SPNP16150 400 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 SLC6A4P31645 630 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 CA5AP35218 305 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 CDKN2CP42773 168 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 HUNKP57058 714 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 IFITM2Q01629 132 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 MVKQ03426 396 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 SMU1Q2TAY7 513 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 STEAP3Q658P3 488 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 RMDN1Q96DB5 314 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 PYURFQ96I23 114 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 C8orf48Q96LL4 319 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 DACH2Q96NX9 599 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 INPP5KQ9BT40 448 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 DPY30Q9C005 99 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 SP140LQ9H930 580 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 SPC25Q9HBM1 224 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 BPIFA1Q9NP55 256 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.45□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 BRCA2P51587 3418 aa6.44□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 A0A096LPI6 279 aa6.44□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.44□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 METTL15A6NJ78 407 aa6.44□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 CLDN24A6NM45 220 aa6.44□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 C2orf81A6NN90 581 aa6.44□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 E5RI56 91 aa6.44□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 H7C0S8 307 aa6.44□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 INSIG1O15503 277 aa6.44□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 RGS10O43665 173 aa6.44□□□□□ -1.38
RARB-204ENST00000458646 ZNF623O75123 536 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms