RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 SEPT4O43236 478 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 HS6ST1O60243 411 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 COQ9O75208 318 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 ANGPTL1O95841 491 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 ALDH2P05091 517 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 GGT5P36269 586 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 OR1G1P47890 313 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 TM4SF4P48230 202 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 GP2P55259 537 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 TEKQ02763 1124 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 NKG7Q16617 165 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 MEP1AQ16819 746 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 CLLU1OSQ5K130 101 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 FAM219BQ5XKK7 198 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF280BQ86YH2 543 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 LACC1Q8IV20 430 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 LIX1Q8N485 282 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 CPA6Q8N4T0 437 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 ATAD1Q8NBU5 361 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 FAR1Q8WVX9 515 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 STARD8Q92502 1023 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 YIPF6Q96EC8 236 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 ALPK1Q96QP1 1244 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 SMURF2Q9HAU4 748 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 WWOXQ9NZC7 414 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 MICAL3Q7RTP6 2002 aa16.48■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 ISPDA4D126 451 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 M0R3G1 203 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 TAPBPO15533 448 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 B4GAT1O43505 415 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 ADAMTS4O75173 837 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 CNPP09543 421 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 PCNAP12004 261 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 FPR1P21462 350 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 IGFBP5P24593 272 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 S100A3P33764 101 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 PIGAP37287 484 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 OPRL1P41146 370 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 CSNK1DP48730 415 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 ST13P50502 369 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 C21orf58P58505 322 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 RPS14P62263 151 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 TUBA1BP68363 451 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 SLC35A2P78381 396 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 AQP6Q13520 282 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 SPCS2Q15005 226 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 SPANXN4Q5MJ08 99 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 CPZQ66K79 652 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 LAIR2Q6ISS4 152 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 TUBA1AQ71U36 451 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 IFNL1Q8IU54 200 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 ZBTB2Q8N680 514 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 NCLNQ969V3 563 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 MYEOVQ96EZ4 313 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 CDK15Q96Q40 435 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 ZIC5Q96T25 663 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 PITX2Q99697 317 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 PIF1Q9H611 641 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 CCSER2Q9H7U1 834 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM161AQ9NX61 479 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 MTRRQ9UBK8 725 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 STOML2Q9UJZ1 356 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 CORINQ9Y5Q5 1042 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 SCN8AQ9UQD0 1980 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 CLDN24A6NM45 220 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 F8W810 466 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 B4GALT3O60512 393 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 JRKO75564 520 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 CLDN9O95484 217 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 VAC14Q08AM6 782 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 ITGADQ13349 1161 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 ADGRF1Q5T601 910 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 KDM4DQ6B0I6 523 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 ANKS3Q6ZW76 656 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 P2RY8Q86VZ1 359 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 FAM86B1Q8N7N1 296 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 EFHBQ8N7U6 833 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 ULK4Q96C45 1275 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 CMTM7Q96FZ5 175 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 DACH2Q96NX9 599 aa16.47■□□□□ 0.23
HCLS1-202ENST00000428394 GPR63Q9BZJ6 419 aa16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms