RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410499.1

RNU6-141P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 141, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-141P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 ACTA2P62736 377 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 ACTC1P68032 377 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 ASIC1P78348 528 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 HOXC5Q00444 222 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 MGAT2Q10469 447 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 FUT5Q11128 374 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 MADCAM1Q13477 382 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF141Q15928 474 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 ME3Q16798 604 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 LONRF3Q496Y0 759 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTCAP3Q53RY4 240 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 CCDC93Q567U6 631 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 C1orf94Q6P1W5 598 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 WDR93Q6P2C0 686 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 XRRA1Q6P2D8 792 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 CYB5R4Q7L1T6 521 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 STRADAQ7RTN6 431 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 GPBP1Q86WP2 473 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 DOLPP1Q86YN1 238 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 UNC45BQ8IWX7 931 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 DYNAPQ8N1N2 210 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 ABHD12Q8N2K0 398 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 DNAAF3Q8N9W5 541 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 FAM71DQ8N9W8 422 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 TMEM104Q8NE00 496 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 BBS10Q8TAM1 723 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 RAET1EQ8TD07 263 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 PHYHIPQ92561 330 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 DYRK2Q92630 601 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 C3orf30Q96M34 536 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZBTB18Q99592 522 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 RTP3Q9BQQ7 232 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 TXNDC17Q9BRA2 123 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 NDFIP1Q9BT67 221 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 TEKT3Q9BXF9 490 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 ANGPTL4Q9BY76 406 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 BRD9Q9H8M2 597 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 SRD5A3Q9H8P0 318 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 ERVK-5Q9HDB9 667 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 SIRT7Q9NRC8 400 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 SERINC1Q9NRX5 453 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 RASSF1Q9NS23 344 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 EXOC1Q9NV70 894 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 RLIMQ9NVW2 624 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 CFAP97Q9P2B7 532 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 SLC17A7Q9P2U7 560 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 UVRAGQ9P2Y5 699 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 TMX2Q9Y320 296 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 HES2Q9Y543 173 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 SH3TC1Q8TE82 1336 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 MIA2Q96PC5 1412 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 C7orf66A4D0T2 115 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 CTAGE15A4D2H0 777 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 DPRXA6NFQ7 191 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 WASHC1A8K0Z3 465 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 ANKRD66B4E2M5 251 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 WASH3PC4AMC7 463 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 C9JVG2 144 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 F5H0A9 414 aaPredicted RBP-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 SLCO1B7G3V0H7 640 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 G3V2L1 256 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 K7EP34 96 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 M0QYG6 137 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 TO15178 435 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 SLC19A2O60779 497 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 GAGE7O76087 117 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 CSPG5O95196 566 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 PGM3O95394 542 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 RB1P06400 928 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 RHOXF2BP0C7M4 288 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 CTAGE8P0CG41 777 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 GAGE12FP0CL80 117 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 GAGE12GP0CL81 117 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 GAGE12IP0CL82 117 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 TDGF1P13385 188 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 DARSP14868 501 aaKnown RBP-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 EGR1P18146 543 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 NPY1RP25929 384 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 PRKCIP41743 596 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 TERF1P54274 439 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 PNLIPRP2P54317 469 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 TMPRSS3P57727 454 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 ST8SIA6P61647 398 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF763Q0D2J5 394 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 STRN3Q13033 797 aa-2□□□□□ -2.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms