RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 ALPPP05187 535 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC35B2Q8TB61 432 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 AKTIPQ9H8T0 292 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 MSRAQ9UJ68 235 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 NEMP2A6NFY4 417 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 IGFBP4P22692 258 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPAN5P62079 268 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 EIPR1Q53HC9 387 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 SLCO2A1Q92959 643 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 OR52B2Q96RD2 323 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 FCRL5Q96RD9 977 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 CASP9P55211 416 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL36Q8N4N3 616 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 STON2Q8WXE9 905 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 CRELD1Q96HD1 420 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 NID2Q14112 1375 aa23.7■■□□□ 1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 EPHX1P07099 455 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SP3Q02447 781 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 BNIP3Q12983 259 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 TMBIM1Q969X1 311 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 RIMKLBQ9ULI2 386 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMD9O00233 223 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP6V1G1O75348 118 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 RASGRP1O95267 797 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 LAG3P18627 525 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 XKP51811 444 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 YJEFN3A6XGL0 299 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKD3O94806 890 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 IL7RP16871 459 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ING5Q8WYH8 240 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 NKD1Q969G9 470 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 LPIN3Q9BQK8 851 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 LGR4Q9BXB1 951 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 PCBD2Q9H0N5 130 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 PRORSD1PA6NEY8 169 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 H3BSA7 217 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 PRAMEF12O95522 483 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ALAS2P22557 587 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ACSL1P33121 698 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAM8P78325 824 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 TBX5Q99593 518 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 GATBO75879 557 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ACVR2AP27037 513 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF234Q14588 700 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ARMC10Q8N2F6 343 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 OXR1Q8N573 874 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 HEPHQ9BQS7 1158 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SLIT3O75094 1523 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SYN3O14994 580 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDH7O60245 1069 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 GNAZP19086 355 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC6A4P31645 630 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 WASP42768 502 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 GRK6P43250 576 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CRISP3P54108 245 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CDH15P55291 814 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 WSCD2Q2TBF2 565 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 FAXDC2Q96IV6 333 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 KCTD7Q96MP8 289 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 EHD1Q9H4M9 534 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 MED11Q9P086 117 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CFL2Q9Y281 166 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ITIH1P19827 911 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ALKBH2Q6NS38 261 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 OR2L3Q8NG85 312 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 TAPBPLQ9BX59 468 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 C8BP07358 591 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 TLR1Q15399 786 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 COX18Q8N8Q8 333 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ITPAQ9BY32 194 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 AMBNQ9NP70 447 aa23.69■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 OR51F1A6NGY5 319 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SAP18O00422 153 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CLUP10909 449 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM159BA6NKW6 160 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 A8MT66 165 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 TLL1O43897 1013 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC10A7Q0GE19 358 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 OR13C4Q8NGS5 318 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 LCN9Q8WX39 176 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC72A6NJI9 287 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 IL1R2P27930 398 aa23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms