RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 TMIEQ8NEW7 156 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
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CAPNS1-201ENST00000246533 PSKH2Q96QS6 385 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 NT5MQ9NPB1 228 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D23Q9NUY8 699 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
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CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 POPDC3Q9HBV1 291 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP10Q9P2G4 905 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 SEPT3Q9UH03 358 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa25.74■■□□□ 1.71
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CAPNS1-201ENST00000246533 PMS2CLQ68D20 193 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC15A3Q8IY34 581 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX26Q8N6G2 289 aa25.74■■□□□ 1.71
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CAPNS1-201ENST00000246533 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
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CAPNS1-201ENST00000246533 MYLKQ15746 1914 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR23AA6NEV1 266 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 PRNPP04156 253 aa25.73■■□□□ 1.71
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CAPNS1-201ENST00000246533 KDELC1Q6UW63 502 aa25.73■■□□□ 1.71
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CAPNS1-201ENST00000246533 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa25.73■■□□□ 1.71
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CAPNS1-201ENST00000246533 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa25.73■■□□□ 1.71
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZSWIM9Q86XI8 627 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
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CAPNS1-201ENST00000246533 BTBD1Q9H0C5 482 aa25.73■■□□□ 1.71
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CAPNS1-201ENST00000246533 PROB1E7EW31 1015 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 NR5A2O00482 541 aa25.72■■□□□ 1.71
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CAPNS1-201ENST00000246533 CAPGP40121 348 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 CDH15P55291 814 aa25.72■■□□□ 1.71
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CAPNS1-201ENST00000246533 USP30Q70CQ3 517 aa25.72■■□□□ 1.71
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CAPNS1-201ENST00000246533 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
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CAPNS1-201ENST00000246533 SCML1Q9UN30 329 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 CLOCKO15516 846 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 GFAPP14136 432 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 LBPP18428 481 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 NELFEP18615 380 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-201ENST00000246533 PI4KAP42356 2102 aa25.71■■□□□ 1.71
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