RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 CCL27Q9Y4X3 112 aa9.3□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 GPR45Q9Y5Y3 372 aa9.3□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1W2PP55 124 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 A8MUI8 341 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 MEI4A8MW99 385 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 H3BM21 787 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 MBTPS2O43462 519 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNJ13O60928 360 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 CIB2O75838 187 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PCDH8O95206 1070 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 KRT6AP02538 564 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 KRT6BP04259 564 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 HOXB2P14652 356 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ACADLP28330 430 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 HMOX2P30519 316 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 GDF5P43026 501 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 KRT6CP48668 564 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 MTTPP55157 894 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SEC13P55735 322 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ABRQ12979 859 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 GRB7Q14451 532 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PON2Q15165 354 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PTCHD3Q3KNS1 767 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 AGKQ53H12 422 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 C6orf136Q5SQH8 315 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 KBTBD6Q86V97 674 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 HEATR4Q86WZ0 1026 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 DSELQ8IZU8 1212 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PLA2G15Q8NCC3 412 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 OR2T11Q8NH01 316 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 OR56A3Q8NH54 315 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 MARK4Q96L34 752 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 CDK15Q96Q40 435 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SERPINI1Q99574 410 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 HEBP1Q9NRV9 189 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ASIC5Q9NY37 505 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ZIM2Q9NZV7 527 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SERGEFQ9UGK8 458 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC7A8Q9UHI5 535 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PLXNA2O75051 1894 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 BPTFQ12830 3046 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 DYTNA2CJ06 578 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 H3BQ06 376 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 MANBAO00462 879 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 AIM2O14862 343 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 LSM1O15116 133 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 RGS14O43566 566 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 NRP2O60462 931 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PEX11AO75192 247 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ULK1O75385 1050 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 C1orf105O95561 183 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ACPPP15309 386 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 CD1EP15812 388 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 IGFBP4P22692 258 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PRPH2P23942 346 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PREPP48147 710 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 HTR6P50406 440 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 NUDT2P50583 147 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PFN3P60673 137 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ACTR3P61158 418 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SGCGQ13326 291 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ART3Q13508 389 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 LRP8Q14114 963 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 E2F2Q14209 437 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 FGL2Q14314 439 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 RPS6KA2Q15349 733 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 EOGTQ5NDL2 527 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 LCE2CQ5TA81 110 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PAOXQ6QHF9 649 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 AGTRAPQ6RW13 159 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 UNC5DQ6UXZ4 953 aa9.28□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 GK5Q6ZS86 529 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms