RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-222	ENST00000592408	KPNA5	O15131	536 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	GRM6	O15303	877 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	RASAL1	O95294	804 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	TRIM16	O95361	564 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	PGM3	O95394	542 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	IL6	P05231	212 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	C8G	P07360	202 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANXA5	P08758	320 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	ALPI	P09923	528 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	OR56A5	P0C7T3	313 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF23	P17027	643 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	GABRR2	P28476	465 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	GRIA2	P42262	883 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	UFM1	P61960	85 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	ESRRG	P62508	458 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	EPS8	Q12929	822 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	9.02	□□□□□ -0.97	2e-7	■□□□□ 8.2
EFTUD2-222	ENST00000592408	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPRED1	Q7Z699	444 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	CBR4	Q8N4T8	237 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	TERB1	Q8NA31	727 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	OR2T11	Q8NH01	316 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	COL26A1	Q96A83	441 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	VPS33A	Q96AX1	596 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	COPS8	Q99627	209 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	BDH2	Q9BUT1	245 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	ADI1	Q9BV57	179 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	CD244	Q9BZW8	370 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		9.02	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408		A0A087WXM4	84 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	ASPDH	A6ND91	283 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408		H3BNH8	94 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	QSOX1	O00391	747 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	OR7A17	O14581	309 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	GSTA4	O15217	222 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC16A5	O15375	505 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	GREM1	O60565	184 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	ULK1	O75385	1050 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANXA6	P08133	673 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	MPC1L	P0DKB6	136 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC2A4	P14672	509 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	ACPP	P15309	386 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	ATP6V1B1	P15313	513 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	BPI	P17213	487 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	HIST1H2AD	P20671	130 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	MYF6	P23409	242 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	HNF1B	P35680	557 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAPK9	P45984	424 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	GNPDA1	P46926	289 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	HSPA7	P48741	367 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	HNMT	P50135	292 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCT8	P50990	548 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	ECT2L	Q008S8	904 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRKCQ	Q04759	706 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	LMAN2	Q12907	356 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	DMC1	Q14565	340 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	CHRNA6	Q15825	494 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	NADK2	Q4G0N4	442 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	IYD	Q6PHW0	289 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		9.01	□□□□□ -0.97
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		9.01	□□□□□ -0.97

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms