RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-211	ENST00000582232	EDEM2	Q9BV94	578 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-211	ENST00000582232	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-211	ENST00000582232	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-211	ENST00000582232	UCK1	Q9HA47	277 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-211	ENST00000582232	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-211	ENST00000582232	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-211	ENST00000582232	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-211	ENST00000582232	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-211	ENST00000582232	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-211	ENST00000582232	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-211	ENST00000582232	PDE10A	Q9Y233	779 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-211	ENST00000582232	PLLP	Q9Y342	182 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-211	ENST00000582232	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GGA3-211	ENST00000582232	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SYCE1L	A8MT33	242 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232		B4DGG1	531 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	MYO1C	O00159	1063 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TRIM38	O00635	465 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TM9SF1	O15321	606 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	FLRT2	O43155	660 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	VIP	P01282	170 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SBK3	P0C264	359 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	GLRB	P48167	497 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	KCNC1	P48547	511 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	GRB7	Q14451	532 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TGFBI	Q15582	683 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PHKG1	Q16816	387 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	INAVA	Q3KP66	663 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TTC23L	Q6PF05	361 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	GPSM1	Q86YR5	675 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ARL14	Q8N4G2	192 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PHC3	Q8NDX5	983 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PATE1	Q8WXA2	126 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ALG9	Q9H6U8	611 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	EMCN	Q9ULC0	261 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TMCO1	Q9UM00	188 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	FFAR2	O15552	330 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SIGLEC6	O43699	453 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	KLK8	O60259	260 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	KDM1A	O60341	852 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PLIN3	O60664	434 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SPAG7	O75391	227 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PROC	P04070	461 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ERG	P11308	486 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CD59	P13987	128 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	MTHFD2	P13995	350 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PNLIP	P16233	465 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	HIST1H2AD	P20671	130 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	HSD17B2	P37059	387 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	GRK6	P43250	576 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	RPIA	P49247	311 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	HHEX	Q03014	270 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	NR1D2	Q14995	579 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	KY	Q8NBH2	561 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PDPR	Q8NCN5	879 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	RDH11	Q8TC12	318 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	APOLD1	Q96LR9	279 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CCDC138	Q96M89	665 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PHOX2B	Q99453	314 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	MENT	Q9BUN1	341 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	XPR1	Q9UBH6	696 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	RNF112	Q9ULX5	631 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PCM1	Q15154	2024 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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