RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561395.5

TPM1-231, Transcript of tropomyosin 1, human

TSL 5

Gene TPM1, Length 673 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPM1-231	ENST00000561395	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	EPGN	Q6UW88	154 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF605	Q86T29	641 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CUZD1	Q86UP6	607 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PACS2	Q86VP3	889 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PDPR	Q8NCN5	879 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	AGR3	Q8TD06	166 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ELMO1	Q92556	727 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	FAR2	Q96K12	515 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	EBF4	Q9BQW3	602 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	COG4	Q9H9E3	785 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	RDH14	Q9HBH5	336 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CD274	Q9NZQ7	290 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SCML1	Q9UN30	329 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CDYL	Q9Y232	598 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM202	A6NGA9	273 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	OR2AG2	A6NM03	316 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM233	B4DJY2	109 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395		J3QKU1	62 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	FCHO1	O14526	889 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	RAD51B	O15315	384 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	HDAC3	O15379	428 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	FFAR2	O15552	330 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	GRID2	O43424	1007 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	VEGFD	O43915	354 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	DIAPH2	O60879	1101 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	GPC4	O75487	556 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TM7SF2	O76062	418 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SUPT7L	O94864	414 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PCDH8	O95206	1070 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CFI	P05156	583 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PCCB	P05166	539 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	C8G	P07360	202 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	VCL	P18206	1134 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TEAD1	P28347	426 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SCTR	P47872	440 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	AGTR2	P50052	363 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	IDH3A	P50213	366 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ADPRH	P54922	357 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	BNIP1	Q12981	228 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	LCP2	Q13094	533 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SP140	Q13342	867 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	IRF4	Q15306	451 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SYTL3	Q4VX76	610 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	EOGT	Q5NDL2	527 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ANKS6	Q68DC2	871 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PNCK	Q6P2M8	343 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TRIM74	Q86UV6	250 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SYT12	Q8IV01	421 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	VRK3	Q8IV63	474 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF843	Q8N446	348 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CEP76	Q8TAP6	659 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	MAPK15	Q8TD08	544 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	GANC	Q8TET4	914 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	DLG3	Q92796	817 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	GLMN	Q92990	594 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	COX14	Q96I36	57 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	HIC2	Q96JB3	615 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23

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