RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 NLNQ9BYT8 704 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 CEP41Q9BYV8 373 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PCDH9Q9HC56 1237 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ABI3Q9P2A4 366 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 DNPEPQ9ULA0 475 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 CHKBQ9Y259 395 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 E9PLN8 166 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PSMD11O00231 422 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PMPCBO75439 489 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PRLP01236 227 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ZNF30P17039 623 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 CD53P19397 219 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 NFKB1P19838 968 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 FASLGP48023 281 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 EPHB1P54762 984 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.312e-7■■■■□ 22.2
CS-225ENST00000551253 MPP3Q13368 585 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PEX6Q13608 980 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ACOX1Q15067 660 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 CNGA3Q16281 694 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PELI3Q8N2H9 469 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 MAIP1Q8WWC4 291 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ASB5Q8WWX0 329 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 TRIB3Q96RU7 358 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 TEX101Q9BY14 249 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 UCK2Q9BZX2 261 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 GBA3Q9H227 469 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 L3MBTL1Q9Y468 752 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 C5orf60A6NFR6 353 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 KLK8O60259 260 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 KIF5CO60282 957 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 NDST3O95803 873 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 EPOP01588 193 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 FUCA1P04066 466 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 CEACAM5P06731 702 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 IVLP07476 585 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 CTPS1P17812 591 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 LHCGRP22888 699 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 MSNP26038 577 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 TEAD1P28347 426 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 SEPHS1P49903 392 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 GEMP55040 296 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 GALNT3Q14435 633 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 QPCTQ16769 361 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 LRRC66Q68CR7 880 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 KDELC1Q6UW63 502 aa6.87□□□□□ -1.31
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