RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 SLC17A7Q9P2U7 560 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PPM1 405 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TSPAN6O43657 245 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 DHFRP00374 187 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SHMT2P34897 504 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 PPP3R1P63098 170 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SMU1Q2TAY7 513 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 COX18Q8N8Q8 333 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 EPB41L1Q9H4G0 881 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 KCNJ11Q14654 390 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SLC29A4Q7RTT9 530 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 CMC1Q7Z7K0 106 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SCGB3A2Q96PL1 93 aa8.35□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 ERVK-5Q9HDB9 667 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TDP1Q9NUW8 608 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 YJEFN3A6XGL0 299 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 CXCR6O00574 342 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MVKQ03426 396 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 OTOP2Q7RTS6 562 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TNS4Q8IZW8 715 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 NLGN2Q8NFZ4 835 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC46Q96FV0 321 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 B3GALT6Q96L58 329 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 GMLQ99445 158 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC3Q9BY71 257 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 RERGLQ9H628 205 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 CAB39LQ9H9S4 337 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 IL23AQ9NPF7 189 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 H0YGN5 161 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 KCNA5P22460 613 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SLC1A2P43004 574 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 DNASE1L1P49184 302 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TLE2Q04725 743 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 PYDC2Q56P42 97 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 C22orf39Q6P5X5 142 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 C12orf40Q86WS4 652 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SCML4Q8N228 414 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 GPR152Q8TDT2 470 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MGME1Q9BQP7 344 aa8.34□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 DHRS7Q9Y394 339 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 FADS3Q9Y5Q0 445 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 H0YC42 278 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MNDAP41218 407 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 HSPA7P48741 367 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 IDH3AP50213 366 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SNAPC1Q16533 368 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.34□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 DGAT2Q96PD7 388 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 FFAR2O15552 330 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 BANF1O75531 89 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 PIRTP0C851 137 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 RPS9P46781 194 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MPP1Q00013 466 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 NPY5RQ15761 445 aa8.34□□□□□ -1.07
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PTPRB-208ENST00000550358 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 GK5Q6ZS86 529 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 CYS1Q717R9 158 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TRAM1L1Q8N609 369 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 OR4C6Q8NH72 309 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 SLC2A13Q96QE2 648 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MVB12BQ9H7P6 319 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 NMUR1Q9HB89 426 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 MAP10Q9P2G4 905 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 VPS29Q9UBQ0 182 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 TEX46H3BTG2 121 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF823P16415 610 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-208ENST00000550358 EDNRBP24530 442 aa8.34□□□□□ -1.07
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