RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FNBP1LQ5T0N5 605 aa9.77□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa9.77□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 METRNLQ641Q3 311 aa9.77□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.77□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TEX26Q8N6G2 289 aa9.77□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9.77□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRB3Q9BUF7 120 aa9.77□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HES7Q9BYE0 225 aa9.77□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR63Q9BZJ6 419 aa9.77□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTR10Q9NZ32 417 aa9.77□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EDARQ9UNE0 448 aa9.77□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF6Q9Y252 685 aa9.77□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAU2Q9Y6X3 613 aa9.77□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIVEP2P31629 2446 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM171A2A8MVW0 826 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C2orf74A8MZ97 194 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PES1O00541 588 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTI1O43156 1089 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASNA1O43681 348 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRPSAP2O60256 369 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UGT1A9O60656 530 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MLYCDO95822 493 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UGT1A6P19224 532 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UGT1A1P22309 533 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD86P42081 329 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCDC1P59894 354 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF33BQ06732 778 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRKG2Q13237 762 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEFB113Q30KQ7 82 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDPK2PQ6A1A2 396 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TLDC1Q6P9B6 456 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NEK10Q6ZWH5 1172 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COX15Q7KZN9 410 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF677Q86XU0 584 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDC20BQ86Y33 519 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MARVELD2Q8N4S9 558 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DTWD1Q8N5C7 304 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHC3Q8NDX5 983 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACVR1CQ8NER5 493 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LILRB4Q8NHJ6 448 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FKBP10Q96AY3 582 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RMDN2Q96LZ7 410 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZWILCHQ9H900 591 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR54Q9H977 334 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UGT1A7Q9HAW7 530 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UGT1A10Q9HAW8 530 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UGT1A8Q9HAW9 530 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD10Q9NXR5 420 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL17CQ9P0M4 197 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HCFC1P51610 2035 aa9.76□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1B0GX78 115 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A8MUI8 341 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3BRJ5 948 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WIPF1O43516 503 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALBP02768 609 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERPINA7P05543 415 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TPOP07202 933 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ITGAMP11215 1152 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UCHL3P15374 230 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFS1P28331 727 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MIPP30301 263 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHRNB4P30926 498 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXC12P31275 282 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARL4AP40617 200 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GABRA4P48169 554 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HCAR3P49019 387 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF165P49910 485 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB28P51157 221 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GSCP56915 257 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLC1Q07866 573 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GTF3C1Q12789 2109 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KEAP1Q14145 624 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC5A12Q1EHB4 618 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABHD17BQ5VST6 288 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNSTQ6PJW8 725 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPESP1Q6UW49 350 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFAF7Q7L592 441 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMC3Q7Z5M5 1100 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AMIGO1Q86WK6 493 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFAP206Q8IYR0 622 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLYBLQ8N0X4 340 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EID3Q8N140 333 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms