RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528478.1

SBF2-208, Transcript of SET binding factor 2, human

TSL 4

Gene SBF2, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SBF2-208	ENST00000528478	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SBF2-208	ENST00000528478	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SBF2-208	ENST00000528478	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SBF2-208	ENST00000528478	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SBF2-208	ENST00000528478	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SBF2-208	ENST00000528478	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SBF2-208	ENST00000528478	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SBF2-208	ENST00000528478	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SBF2-208	ENST00000528478	SNX12	Q9UMY4	172 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SBF2-208	ENST00000528478	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SBF2-208	ENST00000528478	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SBF2-208	ENST00000528478	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SBF2-208	ENST00000528478	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SBF2-208	ENST00000528478	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SBF2-208	ENST00000528478	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SBF2-208	ENST00000528478	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	ACACB	O00763	2458 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	FRY	Q5TBA9	3013 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478		A8MXE2	369 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478		A8MXQ7	604 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478		F8VZ95	297 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478		O00370	1275 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	CES2	O00748	559 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	PJA2	O43164	708 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	COCH	O43405	550 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	GOSR1	O95249	250 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	OLFM2	O95897	454 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	APOD	P05090	189 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	CFI	P05156	583 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	SBK3	P0C264	359 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	MYBL1	P10243	752 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	IRF1	P10914	325 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	P4HA1	P13674	534 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	CEACAM1	P13688	526 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	BMP7	P18075	431 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	GNAZ	P19086	355 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	TNNI1	P19237	187 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	CALB2	P22676	271 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	YWHAQ	P27348	245 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	PCK1	P35558	622 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	P2RY2	P41231	377 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	GSTM5	P46439	218 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	CPA2	P48052	419 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	HK2	P52789	917 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	MYL6	P60660	151 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	TNNC1	P63316	161 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	SLC7A9	P82251	487 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	PIGF	Q07326	219 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	AP1B1	Q10567	949 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	CUL1	Q13616	776 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	ALCAM	Q13740	583 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	GSTA3	Q16772	222 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	KAZN	Q674X7	775 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SBF2-208	ENST00000528478	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.08	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms