RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517992.1

SNTB1-202, Transcript of syntrophin beta 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNTB1, Length 2,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1-202ENST00000517992 RETP07949 1114 aa24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 CBSLP0DN79 551 aa24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 PCSK2P16519 638 aa24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 SHMT2P34897 504 aa24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 CBSP35520 551 aa24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 PTPN5P54829 565 aa24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 VEPH1Q14D04 833 aa24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 ATG9BQ674R7 924 aa24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 FAM117BQ6P1L5 589 aa24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 ITIH5Q86UX2 942 aa24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 VN1R3Q9BXE9 311 aa24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 ING2Q9H160 280 aa24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 MAGIXQ9H6Y5 334 aa24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 ADGRE2Q9UHX3 823 aa24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 CRLS1Q9UJA2 301 aa24.44■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 EPB42P16452 691 aa24.43■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 IL1RNP18510 177 aa24.43■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 IMPG1Q17R60 797 aa24.43■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 SPANXN4Q5MJ08 99 aa24.43■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 GRAMD4Q6IC98 578 aa24.43■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 OR10A6Q8NH74 314 aa24.43■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 NUDT8Q8WV74 236 aa24.43■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 VWCEQ96DN2 955 aa24.43■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 SLC47A1Q96FL8 570 aa24.43■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 OSBPL10Q9BXB5 764 aa24.43■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 C1orf109Q9NX04 203 aa24.43■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 FAM220BPB1ANY3 271 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 FFAR3O14843 346 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 GPR42O15529 346 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 GREM1O60565 184 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 NOL3O60936 208 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 BPIP17213 487 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 SPAM1P38567 509 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 GALK1P51570 392 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 TMBIM6P55061 237 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 Q6ZNB5 142 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 TMEM26Q6ZUK4 368 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 FAM217AQ8IXS0 508 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 MICU2Q8IYU8 434 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 CLDN19Q8N6F1 224 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 FAM86B1Q8N7N1 296 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 FNDC8Q8TC99 324 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 PHF12Q96QT6 1004 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 TM6SF2Q9BZW4 377 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 LIMD1Q9UGP4 676 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 CCDC85CA6NKD9 419 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 CXCR6O00574 342 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 STT3AP46977 705 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 PPP2R2BQ00005 443 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 ENPP6Q6UWR7 440 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 GPR149Q86SP6 731 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 PLPP6Q8IY26 295 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 RGL4Q8IZJ4 473 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 NXPE1Q8N323 547 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 ULK4Q96C45 1275 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 ACTR8Q9H981 624 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa24.42■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 AGAP14A8MT82 685 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 KIAA0355O15063 1070 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 ABCB7O75027 752 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 ERN1O75460 977 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 SEC14L2O76054 403 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 TIMP1P01033 207 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 PCNAP12004 261 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 GDF5P43026 501 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 YAP1P46937 504 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 HMGCS1Q01581 520 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 NEDD8Q15843 81 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 NKG7Q16617 165 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 KIAA1841Q6NSI8 718 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 KLHL35Q6PF15 583 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 FAM9CQ8IZT9 166 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 FBXO30Q8TB52 745 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 WFDC5Q8TCV5 224 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 ACDQ96AP0 544 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 PPP1R14BQ96C90 147 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 TOR3AQ9H497 397 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 IKZF5Q9H5V7 419 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 KCTD5Q9NXV2 234 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 KIAA1671Q9BY89 1806 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 SH3PXD2BA1X283 911 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 LOC730098B7Z3J9 87 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 K7ERQ8 282 aa24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SNTB1-202ENST00000517992 SEC22BO75396 215 aa24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms