RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ABR	Q12979	859 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	PWP1	Q13610	501 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	MYBPC3	Q14896	1274 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	LLGL1	Q15334	1064 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	MLIP	Q5VWP3	458 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNT16	Q8N428	558 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC53	A6NM62	1247 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511		E7EQ34	232 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNK1	O00180	336 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CD48	P09326	243 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	GZMA	P12544	262 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	HLA-DPA1	P20036	260 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	NTF4	P34130	210 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	RORA	P35398	523 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	FOLR3	P41439	243 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	NFE2L1	Q14494	772 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP2R5E	Q16537	467 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP2A13	Q16696	494 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CARF	Q8N187	725 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	KCTD6	Q8NC69	237 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	FATE1	Q969F0	183 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	EID2B	Q96D98	161 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	C12orf66	Q96MD2	445 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	TSGA13	Q96PP4	275 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS35	Q96QK1	796 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	BTRC	Q9Y297	605 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	HEATR9	A2RTY3	570 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2AG2	A6NM03	316 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	MMP2	P08253	660 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	HBQ1	P09105	142 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGA3	P26006	1051 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	AKT1	P31749	480 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SSPN	Q14714	243 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	DCAF10	Q5QP82	559 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CUZD1	Q86UP6	607 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	HOOK3	Q86VS8	718 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	RELL1	Q8IUW5	271 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR135	Q8IZ08	494 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1L3	Q8NH93	324 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CNDP1	Q96KN2	507 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	PPM1M	Q96MI6	270 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	GBP5	Q96PP8	586 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SYT11	Q9BT88	431 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	WWP1	Q9H0M0	922 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73

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