RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495653.1

PTPN23-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 23, human

TSL 2

Gene PTPN23, Length 676 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN23-205	ENST00000495653	CXADR	P78310	365 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	CNST	Q6PJW8	725 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	DTX1	Q86Y01	620 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	ZBTB2	Q8N680	514 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF592	Q92610	1267 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	SLC30A3	Q99726	388 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	ERP44	Q9BS26	406 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	NAT9	Q9BTE0	207 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	MED16	Q9Y2X0	877 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	NFS1	Q9Y697	457 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	KRT87P	A6NCN2	255 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	C2orf74	A8MZ97	194 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	MATN2	O00339	956 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	PVR	P15151	417 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF28	P17035	718 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	BDKRB1	P46663	353 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	TMPRSS3	P57727	454 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	HSD11B2	P80365	405 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	TUBB3	Q13509	450 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	GRB7	Q14451	532 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	GBX1	Q14549	363 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	TRIM73	Q86UV7	250 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	KMT5C	Q86Y97	462 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	CERS2	Q96G23	380 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	IL17F	Q96PD4	163 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	SPRY4	Q9C004	299 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	PRORY	Q9H606	182 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	CDC23	Q9UJX2	597 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	EFS	O43281	561 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	RAD1	O60671	282 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	STK17B	O94768	372 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	RPN2	P04844	631 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	ST6GAL1	P15907	406 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	UGT2B7	P16662	529 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	PKLR	P30613	574 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	CLCN7	P51798	805 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	UCN	P55089	124 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	CUL1	Q13616	776 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	GPR19	Q15760	415 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	KYNU	Q16719	465 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	MANEA	Q5SRI9	462 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	DUPD1	Q68J44	220 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	D2HGDH	Q8N465	521 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	BBOF1	Q8ND07	529 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	NKD1	Q969G9	470 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	LRRC39	Q96DD0	335 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	NDN	Q99608	321 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	GPR21	Q99679	349 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	ZPBP	Q9BS86	351 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	MENT	Q9BUN1	341 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN23-205	ENST00000495653	FGF21	Q9NSA1	209 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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