RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 STRA8Q7Z7C7 330 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 SLC26A11Q86WA9 606 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 AMIGO1Q86WK6 493 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 OOSP2Q86WS3 158 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 PLXDC1Q8IUK5 500 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 GPATCH11Q8N954 259 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 LCN9Q8WX39 176 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 PPM1MQ96MI6 270 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 FMO2Q99518 471 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 OLFM1Q99784 485 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 CMKLR1Q99788 373 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 MENTQ9BUN1 341 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 RAB33BQ9H082 229 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 SRMSQ9H3Y6 488 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 OCIAD1Q9NX40 245 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 KLHL42Q9P2K6 505 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 EPHA6Q9UF33 1036 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 PISDQ9UG56 409 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 DHRS7Q9Y394 339 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-216ENST00000495123 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 GSAPA4D1B5 854 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 FAM159BA6NKW6 160 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 EFCAB7A8K855 629 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 ARHGEF33A8MVX0 844 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 TAF4O00268 1085 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 PLD2O14939 933 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 HGSO14964 777 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 TNFSF15O95150 251 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 MATN4O95460 622 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 GSTA2P09210 222 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 JMJD7P0C870 316 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 FDXRP22570 491 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 MCM3P25205 808 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 ATP5DP30049 168 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 PKLRP30613 574 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 SEPHS1P49903 392 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 MAPK10P53779 464 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.077e-7■■□□□ 14
PKP4-216ENST00000495123 ZNF460Q14592 562 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 KYNUQ16719 465 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 TTLL9Q3SXZ7 439 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 TEX35Q5T0J7 233 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 CACHD1Q5VU97 1274 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 FAM45BPQ6NSW5 357 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 ARMC6Q6NXE6 501 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 KLHL35Q6PF15 583 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 PAQR3Q6TCH7 311 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 UNC5DQ6UXZ4 953 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 CYHR1Q6ZMK1 362 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 CYS1Q717R9 158 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 PRSS42Q7Z5A4 293 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 RELL1Q8IUW5 271 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 FAM45AQ8TCE6 357 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 FBF1Q8TES7 1133 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 CDKL2Q92772 493 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 INPP5DQ92835 1189 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 PMEPA1Q969W9 287 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 ZDHHC12Q96GR4 267 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 ELMO2Q96JJ3 720 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 SLC46A1Q96NT5 459 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 IL17FQ96PD4 163 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 MAP3K3Q99759 626 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 FAM129AQ9BZQ8 928 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 ASCL3Q9NQ33 180 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 TAS2R13Q9NYV9 303 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 ACTR10Q9NZ32 417 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 POLG2Q9UHN1 485 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 NFU1Q9UMS0 254 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 VWA7Q9Y334 891 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 CACNA1AO00555 2505 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa8.38□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 CDRT15L2A8MXV6 281 aa8.38□□□□□ -1.07
PKP4-216ENST00000495123 C9orf172C9J069 976 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms