RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488015.5

SRI-208, Transcript of sorcin, human

TSL 2

Gene SRI, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRI-208	ENST00000488015	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	SERPINB11	Q96P15	392 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015		B4DGG1	531 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015		B4E171	279 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015		K7ERQ8	282 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ZW10	O43264	779 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	B4GAT1	O43505	415 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	RRM1	P23921	792 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PTGS2	P35354	604 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	TSPAN7	P41732	249 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PGD	P52209	483 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	VAV2	P52735	878 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	LIMK2	P53671	638 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PMS2	P54278	862 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	RAD23B	P54727	409 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	DAG1	Q14118	895 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	IQCB1	Q15051	598 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	UBA3	Q8TBC4	463 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ALG14	Q96F25	216 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	CISH	Q9NSE2	258 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SRI-208	ENST00000488015	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.48	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms