RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 RFXANKO14593 260 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ANPEPP15144 967 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 SPINT3P49223 89 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 SH3BP2P78314 561 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 GRB7Q14451 532 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 EPGNQ6UW88 154 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 RRM2BQ7LG56 351 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 FBXW8Q8N3Y1 598 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ROGDIQ9GZN7 287 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 DERL2Q9GZP9 239 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 OR1A2Q9Y585 309 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CAPN8A6NHC0 703 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 MID1O15344 667 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 TIPRLO75663 272 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 RPN2P04844 631 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ARNTP27540 789 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 HOXC13P31276 330 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ACTR1BP42025 376 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 PLA2G16P53816 162 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 MTPNP58546 118 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ACTR1AP61163 376 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 PWP1Q13610 501 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 PAGE2BQ5JRK9 111 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 MTSS1LQ765P7 747 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 DHDDSQ86SQ9 333 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 C17orf64Q86WR6 236 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 HORMAD1Q86X24 394 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 LIX1Q8N485 282 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 IL17FQ96PD4 163 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 RTKNQ9BST9 563 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 WDR26Q9H7D7 661 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 AP4S1Q9Y587 144 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 NDUFS2O75306 463 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 KCNH1O95259 989 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CYP17A1P05093 508 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 DHRS4L1P0CG22 281 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 AMD1P17707 334 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 POU1F1P28069 291 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 FOXA1P55317 472 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 UFM1P61960 85 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 PHKG1Q16816 387 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM219BQ5XKK7 198 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 OTUB2Q96DC9 234 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC30A3Q99726 388 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 FASP25445 335 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 KCNC1P48547 511 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 LSM3P62310 102 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 NFKB2Q00653 900 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF234Q14588 700 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 REP15Q6BDI9 236 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CATSPER1Q8NEC5 780 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 GIPC3Q8TF64 312 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 RNF31Q96EP0 1072 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 GULP1Q9UBP9 304 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 PRKAG3Q9UGI9 489 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 POMPQ9Y244 141 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 SBF1O95248 1867 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 PCP4L1A6NKN8 68 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC28A1O00337 649 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 VNN2O95498 520 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 MMP2P08253 660 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 IDSP22304 550 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ACRV1P26436 265 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 DMC1Q14565 340 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF549Q6P9A3 640 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 PARGQ86W56 976 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 MZB1Q8WU39 189 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms