RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	INA	Q16352	499 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	TRIM73	Q86UV7	250 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	PHC3	Q8NDX5	983 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	FKBP10	Q96AY3	582 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	TEKT5	Q96M29	485 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	XKR8	Q9H6D3	395 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	WDR54	Q9H977	334 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	VPS13C	Q709C8	3753 aa		10.19	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	FBN3	Q75N90	2809 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	UNC5C	O95185	931 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	PRAMEF1	O95521	474 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	UGT2B7	P16662	529 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	AGA	P20933	346 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	CHRNA4	P43681	627 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	TAS2R40	P59535	323 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ARG2	P78540	354 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	TMPRSS15	P98073	1019 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279		Q0VFX4	171 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	PRKG2	Q13237	762 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	NKG7	Q16617	165 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	KDELC1	Q6UW63	502 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	RAPGEF5	Q92565	580 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	DLG3	Q92796	817 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	C14orf79	Q96F83	325 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	OLFM3	Q96PB7	478 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	OR2A14	Q96R47	310 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SPSB2	Q99619	263 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ASB8	Q9H765	288 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	COG4	Q9H9E3	785 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		10.18	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ACAN	P16112	2415 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279		A0A0J9YY10	115 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	DYTN	A2CJ06	578 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ZNF487	B1APH4	448 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	C19orf84	I3L1E1	186 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	APOL1	O14791	398 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	PROSC	O94903	275 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	RALB	P11234	206 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ITGAX	P20702	1163 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	PTPN3	P26045	913 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	GCGR	P47871	477 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	PRLHR	P49683	370 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	TNFSF10	P50591	281 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ARSF	P54793	590 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	RBPJ	Q06330	500 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	PTPRCAP	Q14761	206 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SLC1A5	Q15758	541 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	RBBP7	Q16576	425 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	NPNT	Q6UXI9	565 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	HAS2	Q92819	552 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	HGH1	Q9BTY7	390 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ABI3	Q9P2A4	366 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	ICK	Q9UPZ9	632 aa		10.17	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279		A0A1B0GX78	115 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	AGAP14	A8MT82	685 aa		10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
APTX-222	ENST00000478279	CLDN14	O95500	239 aa		10.16	□□□□□ -0.78

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