RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 NRROSQ86YC3 692 aa25.24■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 TRIM42Q8IWZ5 723 aa25.24■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 FBXO39Q8N4B4 442 aa25.24■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 PDPRQ8NCN5 879 aa25.24■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa25.24■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 GPBAR1Q8TDU6 330 aa25.24■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 LRRC8CQ8TDW0 803 aa25.24■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 SKA1Q96BD8 255 aa25.24■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 PHF21BQ96EK2 531 aa25.24■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 MANSC1Q9H8J5 431 aa25.24■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 DNAJC28Q9NX36 388 aa25.24■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa25.24■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 CD274Q9NZQ7 290 aa25.24■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 SUSD2Q9UGT4 822 aa25.24■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 ARHGAP33O14559 1287 aa25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 CATP04040 527 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 CSF2P04141 144 aa25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 NME1P15531 152 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 JUNDP17535 347 aa25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 RPIAP49247 311 aa25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 C21orf59P57076 290 aa25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 DNAJB13P59910 316 aa25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 TCEA2Q15560 299 aa25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 TEAD4Q15561 434 aa25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 PFKFB4Q16877 469 aa25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 UNC5DQ6UXZ4 953 aa25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 RGS9BPQ6ZS82 235 aa25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 OR6Y1Q8NGX8 325 aa25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 TRIM54Q9BYV2 358 aa25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 PCDH15Q96QU1 1955 aa25.23■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 C1orf105O95561 183 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 GUCA1CO95843 209 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 LSP1P33241 339 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 ACTR1BP42025 376 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 BDKRB1P46663 353 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 ACTR1AP61163 376 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 CDKL1Q00532 357 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 BNC1Q01954 994 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 CES4AQ5XG92 561 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 SLC30A9Q6PML9 568 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 RABEPKQ7Z6M1 372 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 MCOLN3Q8TDD5 553 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 TMEM237Q96Q45 408 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 PRDM8Q9NQV8 689 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 TBC1D29Q9UFV1 150 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 PDZK1P1A8MUH7 402 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 KLF11O14901 512 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 SNX2O60749 519 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 HIST1H2ADP20671 130 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 AP1S2P56377 157 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 ASPHQ12797 758 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 GRIK2Q13002 908 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 WASH2PQ6VEQ5 465 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 HIST1H2AJQ99878 128 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 H2AFJQ9BTM1 129 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 LRRC61Q9BV99 259 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 GSDMCQ9BYG8 508 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 WASH6PQ9NQA3 447 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 ASF1AQ9Y294 204 aa25.22■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa25.21■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 STX16O14662 325 aa25.21■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 S100BP04271 92 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 SERPINE1P05121 402 aa25.21■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 CTSEP14091 401 aa25.21■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 CLCA4Q14CN2 919 aa25.21■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 SETDB1Q15047 1291 aa25.21■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 CDKL4Q5MAI5 379 aa25.21■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa25.21■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa25.21■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 MINDY1Q8N5J2 469 aa25.21■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 L3HYPDHQ96EM0 354 aa25.21■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 EGFL8Q99944 293 aa25.21■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 ARL15Q9NXU5 204 aa25.21■■□□□ 1.63
SOBP-202ENST00000477448 A0A1B0GVT2 93 aa25.2■■□□□ 1.62
SOBP-202ENST00000477448 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SOBP-202ENST00000477448 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SOBP-202ENST00000477448 ANXA5P08758 320 aa25.2■■□□□ 1.62
SOBP-202ENST00000477448 IMPDH1P20839 514 aa25.2■■□□□ 1.62
SOBP-202ENST00000477448 NAGLUP54802 743 aa25.2■■□□□ 1.62
SOBP-202ENST00000477448 HERVK_113P63132 956 aa25.2■■□□□ 1.62
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