RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 CD70P32970 193 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 NSG1P42857 185 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 CYP4F8P98187 520 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 USP7Q93009 1102 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 ACPTQ9BZG2 426 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 TOR3AQ9H497 397 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 PARVBQ9HBI1 364 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 SLC6A13Q9NSD5 602 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 KCTD5Q9NXV2 234 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 DNAJB9Q9UBS3 223 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 H3BMQ9 156 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 PRKD3O94806 890 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 KRT6AP02538 564 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 KRT6BP04259 564 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 CKMP06732 381 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 KRT6CP48668 564 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 GALK1P51570 392 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 NOGQ13253 232 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 HS3ST5Q8IZT8 346 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 COG8Q96MW5 612 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 ADNPQ9H2P0 1102 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 NOBOXO60393 691 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 PDYNP01213 254 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 SLC44A4Q53GD3 710 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 LRRC66Q68CR7 880 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 RNF165Q6ZSG1 346 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 OR2AP1Q8NGE2 309 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 CFAP97Q9P2B7 532 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 DCKP27707 260 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 CCR7P32248 378 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 CSNK1DP48730 415 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 RAB33AQ14088 237 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 GALNT13Q8IUC8 556 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 SELENOMQ8WWX9 145 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 COPS8Q99627 209 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 C19orf43Q9BQ61 176 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 SLC29A3Q9BZD2 475 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 SLC32A1Q9H598 525 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 IL21Q9HBE4 155 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 ABCB8Q9NUT2 735 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 ASIC5Q9NY37 505 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 AREL1O15033 823 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 NEK2P51955 445 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 RPS14P62263 151 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 HSPA14Q0VDF9 509 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 PLEKHG6Q3KR16 790 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 FAM117BQ6P1L5 589 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 ZNF773Q6PK81 442 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 SPESP1Q6UW49 350 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 THAP5Q7Z6K1 395 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD46Q86W74 232 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 MICU2Q8IYU8 434 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 OSBPL6Q9BZF3 934 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 PDE10AQ9Y233 779 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 SCELO95171 688 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 OLFM2O95897 454 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 HPRP00739 348 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 GSNP06396 782 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 EPORP19235 508 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 GABRR2P28476 465 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 RFLNAQ6ZTI6 216 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 DET1Q7L5Y6 550 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 FAM217AQ8IXS0 508 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 HHIPL1Q96JK4 782 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 ELOVL6Q9H5J4 265 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 GALNT8Q9NY28 637 aa19.99■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 A0A0J9YVX5 310 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms