RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 SP9P0CG40 484 aa22.67■■□□□ 1.22
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CNN3-202ENST00000394202 PRKG2Q13237 762 aa22.67■■□□□ 1.22
CNN3-202ENST00000394202 C1orf61Q13536 156 aa22.67■■□□□ 1.22
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CNN3-202ENST00000394202 CFAP157Q5JU67 520 aa22.67■■□□□ 1.22
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CNN3-202ENST00000394202 HIST1H2AJQ99878 128 aa22.67■■□□□ 1.22
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CNN3-202ENST00000394202 C12orf66Q96MD2 445 aa22.67■■□□□ 1.22
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CNN3-202ENST00000394202 A0A1B0GTL3 188 aa22.66■■□□□ 1.22
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CNN3-202ENST00000394202 JUNDP17535 347 aa22.66■■□□□ 1.22
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CNN3-202ENST00000394202 GRB7Q14451 532 aa22.66■■□□□ 1.22
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CNN3-202ENST00000394202 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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CNN3-202ENST00000394202 ZBTB26Q9HCK0 441 aa22.66■■□□□ 1.22
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CNN3-202ENST00000394202 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CNN3-202ENST00000394202 TMEM114B3SHH9 223 aa22.65■■□□□ 1.22
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CNN3-202ENST00000394202 CSF2P04141 144 aa22.65■■□□□ 1.22
CNN3-202ENST00000394202 AP1S2P56377 157 aa22.65■■□□□ 1.22
CNN3-202ENST00000394202 ASPHQ12797 758 aa22.65■■□□□ 1.22
CNN3-202ENST00000394202 PRRT3Q5FWE3 981 aa22.65■■□□□ 1.22
CNN3-202ENST00000394202 UNC5DQ6UXZ4 953 aa22.65■■□□□ 1.22
CNN3-202ENST00000394202 AGR3Q8TD06 166 aa22.65■■□□□ 1.22
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CNN3-202ENST00000394202 C7orf26Q96N11 449 aa22.65■■□□□ 1.22
CNN3-202ENST00000394202 LRRC61Q9BV99 259 aa22.65■■□□□ 1.22
CNN3-202ENST00000394202 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa22.65■■□□□ 1.22
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CNN3-202ENST00000394202 A6NCN8 305 aa22.65■■□□□ 1.22
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CNN3-202ENST00000394202 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.65■■□□□ 1.22
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CNN3-202ENST00000394202 OR5K2Q8NHB8 316 aa22.65■■□□□ 1.22
CNN3-202ENST00000394202 CNDP1Q96KN2 507 aa22.65■■□□□ 1.22
CNN3-202ENST00000394202 PNPOQ9NVS9 261 aa22.65■■□□□ 1.22
CNN3-202ENST00000394202 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.65■■□□□ 1.22
CNN3-202ENST00000394202 TMCO1Q9UM00 188 aa22.65■■□□□ 1.22
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CNN3-202ENST00000394202 KITP10721 976 aa22.64■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 NME1P15531 152 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
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CNN3-202ENST00000394202 RPE65Q16518 533 aa22.64■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 CDKL4Q5MAI5 379 aa22.64■■□□□ 1.21
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CNN3-202ENST00000394202 PILRBQ9UKJ0 227 aa22.64■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 MYO1CO00159 1063 aa22.63■■□□□ 1.21
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CNN3-202ENST00000394202 CTSEP14091 401 aa22.63■■□□□ 1.21
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CNN3-202ENST00000394202 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 BNC1Q01954 994 aa22.63■■□□□ 1.21
CNN3-202ENST00000394202 CLCQ05315 142 aa22.63■■□□□ 1.21
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