RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2T6Q8NHC8 308 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 OLIG1Q8TAK6 271 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC107Q8WV48 283 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 SUSD6Q92537 303 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 LPGAT1Q92604 370 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 JAKMIP2Q96AA8 810 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00479Q96M42 142 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUP85Q9BW27 656 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 S1PR5Q9H228 398 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 GIMAP4Q9NUV9 329 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 BARHL2Q9NY43 387 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM181Q9P2C4 612 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTUS1Q9ULD2 1270 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM5Q9Y2B1 443 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 NME7Q9Y5B8 376 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 A8MV72 311 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLF11O14901 512 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAMDEC1O15204 470 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXTL3O43909 919 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR10H2O60403 315 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ENTPD3O75355 529 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDPCPO95876 746 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2T7P0C7T2 308 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT5P13647 590 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PORP16435 677 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEBPBP17676 345 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TYMPP19971 482 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CA6P23280 308 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC6A12P48065 614 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAF6P49848 677 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP10-5P60370 271 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMC6P62333 389 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCLAFQ15004 111 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEAD2Q15562 447 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELFN2Q5R3F8 820 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADIPOR2Q86V24 386 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIGZQ86VD9 579 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP24Q8N264 748 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB42Q8N4Z0 105 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 APPL2Q8NEU8 664 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR4C3Q8NH37 302 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXD1Q8NHP7 514 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGFBP3Q8TAT2 258 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 HPSE2Q8WWQ2 592 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 IRGQQ8WZA9 623 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 DYRK2Q92630 601 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MS4A10Q96PG2 267 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHMP4AQ9BY43 222 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 P2RY12Q9H244 342 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CACNG4Q9UBN1 327 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TUBE1Q9UJT0 475 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHGB4Q9UN71 923 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF215Q9Y6U7 377 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0J9YWU9 116 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLOD5A6NK44 160 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MEIS2O14770 477 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 DPEP1P16444 411 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNASE1P24855 282 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC9A3P48764 834 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 B3GALT5-AS1P59052 145 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP10-12P60413 245 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 STK4Q13043 487 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MZT2BQ6NZ67 158 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM139Q8IV31 216 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDK20Q8IZL9 346 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 LSMEM2Q8N112 164 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MINDY1Q8N5J2 469 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 NIPA2Q8N8Q9 360 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPEPL1Q8NDH3 523 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC22A18Q96BI1 424 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGED4Q96JG8 741 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 POM121L2Q96KW2 1035 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 FNBP1Q96RU3 617 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 OLFM1Q99784 485 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM51Q9BSJ1 452 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 GKN1Q9NS71 199 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGF21Q9NSA1 209 aa2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms