RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 SCYL1Q96KG9 808 aa27.06■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGEF33A8MVX0 844 aa27.05■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM38O00635 465 aa27.05■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 KDM1AO60341 852 aa27.05■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 HIST1H2ADP20671 130 aa27.05■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 HHEXQ03014 270 aa27.05■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 ARL14Q8N4G2 192 aa27.05■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 RAD51AP1Q96B01 352 aa27.05■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa27.05■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 HIST1H2AJQ99878 128 aa27.05■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 H2AFJQ9BTM1 129 aa27.05■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 RNF112Q9ULX5 631 aa27.05■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 SIGLEC6O43699 453 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 BDKRB1P46663 353 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 RPIAP49247 311 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 MAZP56270 477 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 SLC35F3Q8IY50 421 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 HGH1Q9BTY7 390 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 SLC40A1Q9NP59 571 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 OARD1Q9Y530 152 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 KERAO60938 352 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 SYF2O95926 243 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 CREB1P16220 341 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 OR4D1Q15615 310 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 PPP1R3AQ16821 1122 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 HSP90B2PQ58FF3 399 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 TTMPQ5BVD1 217 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 TECRLQ5HYJ1 363 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 DLG3Q92796 817 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 RDH14Q9HBH5 336 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM216Q9P0N5 145 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 PDE10AQ9Y233 779 aa27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 SYCE1LA8MT33 242 aa27.03■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 SPAG7O75391 227 aa27.03■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 AP1S2P56377 157 aa27.03■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 PRKG2Q13237 762 aa27.03■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa27.03■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 GPSM1Q86YR5 675 aa27.03■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 SH3KBP1Q96B97 665 aa27.03■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 APOLD1Q96LR9 279 aa27.03■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 XPR1Q9UBH6 696 aa27.03■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 C4orf47A7E2U8 309 aa27.02■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 PHKG1Q16816 387 aa27.02■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC153Q494R4 210 aa27.02■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 OR6C4Q8NGE1 309 aa27.02■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 CAMK1GQ96NX5 476 aa27.02■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 ATOH8Q96SQ7 321 aa27.02■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 MED4Q9NPJ6 270 aa27.02■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 EVA1BQ9NVM1 165 aa27.02■■□□□ 1.92
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GIPC1-201ENST00000345425 NR0B2Q15466 257 aa27.02■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 TGFBIQ15582 683 aa27.02■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 RAB42Q8N4Z0 105 aa27.02■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
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GIPC1-201ENST00000345425 PADI4Q9UM07 663 aa27.02■■□□□ 1.92
GIPC1-201ENST00000345425 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 MYO1CO00159 1063 aa27.01■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 CD59P13987 128 aa27.01■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 GLB1P16278 677 aa27.01■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 CDKL1Q00532 357 aa27.01■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 OR9A1PQ8NGU1 263 aa27.01■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 RHBDD1Q8TEB9 315 aa27.01■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC138Q96M89 665 aa27.01■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 UCK1Q9HA47 277 aa27.01■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 ARL15Q9NXU5 204 aa27.01■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 BTBD3Q9Y2F9 522 aa27.01■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 PLLPQ9Y342 182 aa27.01■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa27■■□□□ 1.91
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GIPC1-201ENST00000345425 GPR18Q14330 331 aa27■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 C16orf46Q6P387 395 aa27■■□□□ 1.91
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GIPC1-201ENST00000345425 KCNK9Q9NPC2 374 aa27■■□□□ 1.91
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GIPC1-201ENST00000345425 PLCL1Q15111 1095 aa26.99■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 CCSMST1Q4G0I0 132 aa26.99■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 EXT2Q93063 718 aa26.99■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 NUDT4Q9NZJ9 180 aa26.99■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA7Q9P0W8 599 aa26.99■■□□□ 1.91
GIPC1-201ENST00000345425 LRIT1Q9P2V4 623 aa26.99■■□□□ 1.91
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