RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298466.9

SOHLH1-201, Transcript of spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOHLH1, Length 1,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1-201ENST00000298466 VPS11Q9H270 941 aa21.6■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 RDH14Q9HBH5 336 aa21.6■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 DLL3Q9NYJ7 618 aa21.6■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 ACOT9Q9Y305 439 aa21.6■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 A0A1W2PPM1 405 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 A0A1W2PQM1 296 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 GOLGA8RI6L899 631 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 CDH16O75309 829 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 NDUFS1P28331 727 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 MAGEA12P43365 314 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 CLDN6P56747 220 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 CCL7P80098 99 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF844Q08AG5 666 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 USP53Q70EK8 1073 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 KCTD4Q8WVF5 259 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 RTKNQ9BST9 563 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 TLK1Q9UKI8 766 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 BTN3A1O00481 513 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 ZBTB14O43829 449 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 PNLIPP16233 465 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 NR1D2Q14995 579 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 PHKG1Q16816 387 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 AVL9Q8NBF6 648 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 SH3KBP1Q96B97 665 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 NXNL1Q96CM4 212 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 IL17FQ96PD4 163 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 EVA1BQ9NVM1 165 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF358Q9NW07 568 aa21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 ASPMQ8IZT6 3477 aa21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 UNC13CQ8NB66 2214 aa21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 FTH1P19P0C7X4 201 aa21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 CD1DP15813 335 aa21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 GPR3P46089 330 aa21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 TSNQ15631 228 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 RASGRP3Q8IV61 690 aa21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 LCN9Q8WX39 176 aa21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 RSC1A1Q92681 617 aa21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 MTBPQ96DY7 904 aa21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 DERL2Q9GZP9 239 aa21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 PPCSQ9HAB8 311 aa21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 IGSF5Q9NSI5 407 aa21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 ICKQ9UPZ9 632 aa21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 PDE10AQ9Y233 779 aa21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1-201ENST00000298466 UBXN7O94888 489 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 SYF2O95926 243 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 RPN2P04844 631 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 KRT15P19012 456 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 CD1CP29017 333 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 CASP8Q14790 479 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 TIFABQ6ZNK6 161 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 HDXQ7Z353 690 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 PTERQ96BW5 349 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 MENTQ9BUN1 341 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 ABCG4Q9H172 646 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 OGFRQ9NZT2 677 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 POLG2Q9UHN1 485 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 LILRA5A6NI73 299 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 RFPL3O75679 317 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 SASH3O75995 380 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 CATP04040 527 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 GP1BAP07359 652 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 GLRBP48167 497 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 CFHR1Q03591 330 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 SBSNQ6UWP8 590 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 DHRS13Q6UX07 377 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 ZFPM2Q8WW38 1151 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC12A9Q9BXP2 914 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 UCK1Q9HA47 277 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 PCMTD2Q9NV79 361 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM53CQ9NYF3 392 aa21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 SDHBP21912 280 aa21.56■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 KCNC1P48547 511 aa21.56■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 RASA2Q15283 850 aa21.56■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 KRT71Q3SY84 523 aa21.56■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 CEP85LQ5SZL2 805 aa21.56■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 TTC23LQ6PF05 361 aa21.56■■□□□ 1.04
SOHLH1-201ENST00000298466 DENND1AQ8TEH3 1009 aa21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms