RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284116.8

GDPD1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDPD1, Length 1,821 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1-201ENST00000284116 PRSS16Q9NQE7 514 aa18.45■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 DYRK4Q9NR20 520 aa18.45■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 EPS15L1Q9UBC2 864 aa18.45■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa18.45■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 DYTNA2CJ06 578 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 ANTXRLA6NF34 631 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 ANKRD28O15084 1053 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 MMP20O60882 483 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 C6P13671 934 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 DPTQ07507 201 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 PRKG2Q13237 762 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 GGTA1PQ4G0N0 100 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 SYTL3Q4VX76 610 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 NEK5Q6P3R8 708 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 ZFAND4Q86XD8 727 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 SLC15A3Q8IY34 581 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 PQLC1Q8N2U9 271 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 MYADMQ96S97 322 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 ACTL8Q9H568 366 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 NME4O00746 187 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 KAT7O95251 611 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 KRT6AP02538 564 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 KRT6BP04259 564 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 PSMC3P17980 439 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 GNPDA1P46926 289 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 KRT6CP48668 564 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 NFYCQ13952 458 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 MAP7D1Q3KQU3 841 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 SGO1Q5FBB7 561 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 PAGE3Q5JUK9 113 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 SPATA24Q86W54 205 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 L3MBTL4Q8NA19 623 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 CHFRQ96EP1 664 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 HDAC8Q9BY41 377 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 DNAJC11Q9NVH1 559 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 FAM8A1Q9UBU6 413 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 SLC22A14Q9Y267 594 aa18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 ARHGEF33A8MVX0 844 aa18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 K7ESM1 405 aa18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 EPHX1P07099 455 aa18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 SLC6A2P23975 617 aa18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 GPR1P46091 355 aa18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 HMGCS1Q01581 520 aa18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 SPATS1Q496A3 300 aa18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 BCL7AQ4VC05 210 aa18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 LPCAT4Q643R3 524 aa18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 SLC22A15Q8IZD6 547 aa18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 RGL4Q8IZJ4 473 aa18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 PYCR2Q96C36 320 aa18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 ECSITQ9BQ95 431 aa18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 VCX3BQ9H321 246 aa18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 CMTM6Q9NX76 183 aa18.43■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 GRXCR2A6NFK2 248 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 C8BP07358 591 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 HSD17B1P14061 328 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 GRIA2P42262 883 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 PREPP48147 710 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 PFN3P60673 137 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 RPL38P63173 70 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 IMPG1Q17R60 797 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 ATAT1Q5SQI0 421 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 C6orf10Q5SRN2 563 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 IZUMO2Q6UXV1 221 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 RAB7BQ96AH8 199 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 ELSPBP1Q96BH3 223 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 KXD1Q9BQD3 176 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 KLHL4Q9C0H6 718 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 ATG10Q9H0Y0 220 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 LRTM1Q9HBL6 345 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 ASIC5Q9NY37 505 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 SNX6Q9UNH7 406 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 LRCH1Q9Y2L9 728 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 KRT87PA6NCN2 255 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 ARNTLO00327 626 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 LILRB5O75023 590 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 NPPAP01160 153 aa18.42■□□□□ 0.54
GDPD1-201ENST00000284116 PDYNP01213 254 aa18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms