RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590699.5

CARM1-209, Transcript of coactivator associated arginine methyltransferase 1, human

TSL 5

Gene CARM1, Length 2,240 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CARM1-209	ENST00000590699	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		27.57	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		27.57	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	FAM110B	Q8TC76	370 aa		27.57	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	ARRDC3	Q96B67	414 aa		27.57	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		27.57	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	FXYD1	O00168	92 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	AKAP10	O43572	662 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	ITGAL	P20701	1170 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	CLC	Q05315	142 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	LCP2	Q13094	533 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	SNX20	Q7Z614	316 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	27.56	■■■□□ 2	2e-6	■■■■■ 54.9
CARM1-209	ENST00000590699	GUCD1	Q96NT3	240 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	DERL2	Q9GZP9	239 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	BTRC	Q9Y297	605 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	PFDN6	O15212	129 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	SUPT3H	O75486	399 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	RHOBTB1	O94844	696 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	LINC00032	P0C843	101 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	HSD17B1	P14061	328 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	HGF	P14210	728 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	CKMT2	P17540	419 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	PON2	Q15165	354 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	TMIE	Q8NEW7	156 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	TRIM15	Q9C019	465 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	SUN2	Q9UH99	717 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	RNF112	Q9ULX5	631 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	MED16	Q9Y2X0	877 aa		27.56	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	TRIO	O75962	3097 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	AQP12B	A6NM10	295 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699		C9JVG2	144 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	H6PD	O95479	791 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	SPINT3	P49223	89 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	PRKCQ	Q04759	706 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	BIRC8	Q96P09	236 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	HAUS8	Q9BT25	410 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699		A0A1B0GTL3	188 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	IER5L	Q5T953	404 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	ERAP2	Q6P179	960 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699		Q6ZVL8	140 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	BOC	Q9BWV1	1114 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	CMTM6	Q9NX76	183 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	ETAA1	Q9NY74	926 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		27.55	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	SOCS2	O14508	198 aa		27.54	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	IDO1	P14902	403 aa		27.54	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	NFKBIA	P25963	317 aa		27.54	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	ETV3	P41162	512 aa		27.54	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	BNIP2	Q12982	314 aa		27.54	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	SCAMP4	Q969E2	229 aa		27.54	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		27.54	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		27.54	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	DYRK4	Q9NR20	520 aa		27.54	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		27.54	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	GID8	Q9NWU2	228 aa		27.54	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		27.54	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	VPS4B	O75351	444 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	FOSL2	P15408	326 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	SLC6A2	P23975	617 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	ITGB7	P26010	798 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	RPS6KA2	Q15349	733 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	COQ5	Q5HYK3	327 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	KRT80	Q6KB66	452 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	LRRC58	Q96CX6	371 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	HIC2	Q96JB3	615 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	IQCF5	A8MTL0	148 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699		H3BNH8	94 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	NIPSNAP2	O75323	286 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	ZNF30	P17039	623 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	PTGER3	P43115	390 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		27.53	■■■□□ 2
CARM1-209	ENST00000590699	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		27.53	■■■□□ 2

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