RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588477.5

IFT20-216, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene IFT20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-216ENST00000588477 HCRTR1O43613 425 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 SGTAO43765 313 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ALOX12BO75342 701 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 PRAMEF1O95521 474 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 EPOP01588 193 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 UMODP07911 640 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 TSFMP43897 325 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 DYNLT1P63172 113 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 SLC1A5Q15758 541 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 BCL7AQ4VC05 210 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 FIGNQ5HY92 759 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 HOOK3Q86VS8 718 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 RFX6Q8HWS3 928 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 HM13Q8TCT9 377 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 CNDP1Q96KN2 507 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 AP1M1Q9BXS5 423 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 XKR8Q9H6D3 395 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ASB8Q9H765 288 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 UVRAGQ9P2Y5 699 aa14.76□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ZNF487B1APH4 448 aa14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 CTSBP07858 339 aa14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 STSP08842 583 aa14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 PRKG2Q13237 762 aa14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 MESDQ14696 234 aa14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 SPESP1Q6UW49 350 aa14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 IGFL2Q6UWQ7 119 aa14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 AGAP4Q96P64 663 aa14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 SLC6A20Q9NP91 592 aa14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 TXLNGQ9NUQ3 528 aa14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ARL5AQ9Y689 179 aa14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 AKAP9Q99996 3911 aa14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 PKDREJQ9NTG1 2253 aa14.75□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 CCDC78A2IDD5 438 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 SRP72O76094 671 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 H2AFZP0C0S5 128 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 GABRA4P48169 554 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 PRLHRP49683 370 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 NR1I3Q14994 352 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ZIC1Q15915 447 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 SARM1Q6SZW1 724 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 H2AFVQ71UI9 128 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 TRIM73Q86UV7 250 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 IPMKQ8NFU5 416 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 OR4K2Q8NGD2 314 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 COG1Q8WTW3 980 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 DCUN1D1Q96GG9 259 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 IRAK4Q9NWZ3 460 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 TACC2O95359 2948 aa14.74□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 SMTNL1A8MU46 457 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 JRKO75564 520 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 RALBP11234 206 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 PDHA2P29803 388 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 TYRO3Q06418 890 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 WASHC5Q12768 1159 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 PID1Q7Z2X4 250 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 VSIG1Q86XK7 387 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 FCRL5Q96RD9 977 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 HGH1Q9BTY7 390 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 COG4Q9H9E3 785 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 CRLS1Q9UJA2 301 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-216ENST00000588477 CDC23Q9UJX2 597 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms