RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 GLMPQ8WWB7 406 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RASSF5Q8WWW0 418 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PYDC1Q8WXC3 89 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 THAP4Q8WY91 577 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ING5Q8WYH8 240 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SLC5A5Q92911 643 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MYDGFQ969H8 173 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SLAMF9Q96A28 289 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 COA7Q96BR5 231 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 HAUS1Q96CS2 278 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RASD2Q96D21 266 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RNF31Q96EP0 1072 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC51Q96ER9 411 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 DYDC2Q96IM9 177 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 APOLD1Q96LR9 279 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SAMD8Q96LT4 415 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KLHL5Q96PQ7 755 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TWNKQ96RR1 684 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CGRRF1Q99675 332 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SEMA3CQ99985 751 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NDC1Q9BTX1 674 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA16Q9BXB7 569 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CACNG6Q9BXT2 260 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 DERL2Q9GZP9 239 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SLC22A4Q9H015 551 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 VCXQ9H320 206 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 VCX2Q9H322 139 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MUC13Q9H3R2 512 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RNPEPQ9H4A4 650 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 METTL7AQ9H8H3 244 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MAGEE1Q9HCI5 957 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 AKIP1Q9NQ31 210 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ETNK2Q9NVF9 386 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FAIMQ9NVQ4 179 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PAG1Q9NWQ8 432 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CMTM6Q9NX76 183 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 STMN3Q9NZ72 180 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MPP6Q9NZW5 540 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NDUFAF4Q9P032 175 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RNF7Q9UBF6 113 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF229Q9UJW7 825 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CA14Q9ULX7 337 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PLLPQ9Y342 182 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RNF215Q9Y6U7 377 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 U3KQV3 271 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ERCC6Q03468 1493 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 UBN2Q6ZU65 1347 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa3□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 TRIM49BA6NDI0 452 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SNAP23O00161 211 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CBX4O00257 560 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PLK4O00444 970 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TSPAN4O14817 238 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LDLRAD4O15165 306 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SLC22A1O15245 554 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SLC16A6O15403 523 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RNMTO43148 476 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 OPHN1O60890 802 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ECI2O75521 394 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GPX5O75715 221 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 STC2O76061 302 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RHOBTB1O94844 696 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KAT7O95251 611 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHA8P1O95397 391 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ESRRBO95718 433 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 BAG3O95817 575 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ONECUT2O95948 504 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CRYABP02511 175 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GNAI2P04899 355 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KRT8P05787 483 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ANXA5P08758 320 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 STSP08842 583 aa3□□□□□ -1.93
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