RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574011.1

RPH3AL-213, Transcript of rabphilin 3A like (without C2 domains), human

TSL 5

Gene RPH3AL, Length 533 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPH3AL-213	ENST00000574011	CNDP1	Q96KN2	507 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	GBP5	Q96PP8	586 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	NRTN	Q99748	197 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011		A0A1B0GUH1	482 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	IGHE	P01854	428 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	STS	P08842	583 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	MX2	P20592	715 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	CDKN2B	P42772	138 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	MARCKSL1	P49006	195 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	KIF5A	Q12840	1032 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	ART3	Q13508	389 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	KRT33B	Q14525	404 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	GSE1	Q14687	1217 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	NOMO1	Q15155	1222 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	CYP2A13	Q16696	494 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	ODF2	Q5BJF6	829 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	DET1	Q7L5Y6	550 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	KRT35	Q92764	455 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	IL26	Q9NPH9	171 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	CDYL	Q9Y232	598 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	CCDC78	A2IDD5	438 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	BTN3A3	O00478	584 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	APOL1	O14791	398 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	MAP3K7	O43318	606 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	DIAPH2	O60879	1101 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	POLB	P06746	335 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	HBQ1	P09105	142 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	COX6B1	P14854	86 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	PTGER4	P35408	488 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	SOX8	P57073	446 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	KCNK10	P57789	538 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	PPP2R5E	Q16537	467 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	RFX6	Q8HWS3	928 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	GPR135	Q8IZ08	494 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	NXPE1	Q8N323	547 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	LCN9	Q8WX39	176 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	HDAC11	Q96DB2	347 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	AGAP3	Q96P47	875 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	CCDC66	A2RUB6	948 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	BTN3A1	O00481	513 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	PMPCB	O75439	489 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	JRK	O75564	520 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	CTSB	P07858	339 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	UMOD	P07911	640 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	CTNNA2	P26232	953 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	HTR1E	P28566	365 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	AKT1	P31749	480 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	CCZ1B	P86790	482 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RPH3AL-213	ENST00000574011	AP1B1	Q10567	949 aa		10.61	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms