RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMMDC1-208	ENST00000494664	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	HSPA4L	O95757	839 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	BPI	P17213	487 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	SERPINB5	P36952	375 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	NPY2R	P49146	381 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	ZNF284	Q2VY69	593 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	PCID2	Q5JVF3	399 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	SNX32	Q86XE0	403 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	GPR26	Q8NDV2	337 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	SCAMP4	Q969E2	229 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	COQ10A	Q96MF6	247 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	KIFC1	Q9BW19	673 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	SGK2	Q9HBY8	427 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	FZD3	Q9NPG1	666 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	OLAH	Q9NV23	265 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	HACD3	Q9P035	362 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	HEATR9	A2RTY3	570 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	TMEM114	B3SHH9	223 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664		K7ESM1	405 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	ZNF30	P17039	623 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	ARNT	P27540	789 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	ART3	Q13508	389 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	ACOX1	Q15067	660 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	NRF1	Q16656	503 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	CCDC153	Q494R4	210 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	C16orf87	Q6PH81	154 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	HORMAD1	Q86X24	394 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	SCAI	Q8N9R8	606 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	NELL1	Q92832	810 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	BIRC7	Q96CA5	298 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	MYOC	Q99972	504 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	TREX1	Q9NSU2	369 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	LRRC72	A6NJI9	287 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	C2orf81	A6NN90	581 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	TPP1	O14773	563 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	RAD51B	O15315	384 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	CFLAR	O15519	480 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	SP9	P0CG40	484 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	CDH3	P22223	829 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	OXTR	P30559	389 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	CA5A	P35218	305 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	SPINT3	P49223	89 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	MS4A2	Q01362	244 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	NAB1	Q13506	487 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	HERC3	Q15034	1050 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	TMEM135	Q86UB9	458 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	AGAP2	Q99490	1192 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	IL26	Q9NPH9	171 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	PLXNA2	O75051	1894 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664		A0A1B0GTW7	788 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	C7orf72	A4D263	438 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	OR51F1	A6NGY5	319 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	AP3B1	O00203	1094 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	SLC31A1	O15431	190 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	LAT	O43561	262 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	HR	O43593	1189 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	PRSS56	P0CW18	603 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	COL6A2	P12110	1019 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	EPHA3	P29320	983 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	HK2	P52789	917 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TIMMDC1-208	ENST00000494664	CEACAM7	Q14002	265 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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