RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 NEMP2A6NFY4 417 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ARHGEF33A8MVX0 844 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 K7ESM1 405 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 PYCR3Q53H96 274 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ATG9BQ674R7 924 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.29□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 NDE1Q9NXR1 346 aa6.29□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.29□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 ASB1Q9Y576 335 aa6.29□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.29□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 JAK1P23458 1154 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 EMX2Q04743 252 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 KLF10Q13118 480 aa6.29□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.29□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.29□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 TWIST2Q8WVJ9 160 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 OR52B2Q96RD2 323 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.29□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.29□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 ZNF839A8K0R7 811 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 SUPT3HB4E1H0 165 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF217O75362 1048 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 SUPT3HO75486 399 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 KIAA0754O94854 1291 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 SLC4A1P02730 911 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 DNTTP04053 509 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 IGHV4-34P06331 123 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 JUPP14923 745 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 GPR1P46091 355 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 MAPRE2Q15555 327 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF852Q6ZMS4 543 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 CLDN19Q8N6F1 224 aa6.28□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 NELL1Q92832 810 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ROPN1LQ96C74 230 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM74Q96NL1 305 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 MIPEPQ99797 713 aa6.28□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 LTB4R2Q9NPC1 389 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 IGLON5A6NGN9 336 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
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