RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467983.1

ABCB4-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 4, human

TSL 3

Gene ABCB4, Length 414 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB4-208	ENST00000467983	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM159B	A6NKW6	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983		E9PBE3	544 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PLA2G6	O60733	806 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	GLRA3	O75311	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PIAS1	O75925	651 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	GH2	P01242	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	APOE	P02649	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	C1QA	P02745	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SERPINE1	P05121	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	COX4I1	P13073	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CCDC130	P13994	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TNNI1	P19237	187 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	YY1	P25490	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC1A6	P48664	564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF132	P52740	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MTTP	P55157	894 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	OGDH	Q02218	1023 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CNTN2	Q02246	1040 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	GHRHR	Q02643	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	LPIN1	Q14693	890 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	C4orf22	Q6V702	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	KBTBD6	Q86V97	674 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	BBS5	Q8N3I7	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	FNDC8	Q8TC99	324 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	IDI2	Q9BXS1	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM221	A6NGB7	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983		A8MVJ9	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983		H0YJX3	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983		H7C0C1	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CYB561D2	O14569	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ITM2A	O43736	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SERPINB2	P05120	415 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CSH1	P0DML2	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CSH2	P0DML3	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	IDO1	P14902	403 aa		4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms