RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466964.1

LAMC1-202, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

TSL 4

Gene LAMC1, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-202ENST00000466964 C1orf189Q5VU69 101 aa9.9□□□□□ -0.82
LAMC1-202ENST00000466964 ARMC6Q6NXE6 501 aa9.9□□□□□ -0.82
LAMC1-202ENST00000466964 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
LAMC1-202ENST00000466964 TTC30BQ8N4P2 665 aa9.9□□□□□ -0.82
LAMC1-202ENST00000466964 ACVR1CQ8NER5 493 aa9.9□□□□□ -0.82
LAMC1-202ENST00000466964 OR2L2Q8NH16 312 aa9.9□□□□□ -0.82
LAMC1-202ENST00000466964 CHTF18Q8WVB6 975 aa9.9□□□□□ -0.82
LAMC1-202ENST00000466964 MESP1Q9BRJ9 268 aa9.9□□□□□ -0.82
LAMC1-202ENST00000466964 ADGRE3Q9BY15 652 aa9.9□□□□□ -0.82
LAMC1-202ENST00000466964 RNF32Q9H0A6 362 aa9.9□□□□□ -0.82
LAMC1-202ENST00000466964 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
LAMC1-202ENST00000466964 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
LAMC1-202ENST00000466964 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
LAMC1-202ENST00000466964 NDOR1Q9UHB4 597 aa9.9□□□□□ -0.82
LAMC1-202ENST00000466964 ACSL5Q9ULC5 683 aa9.9□□□□□ -0.82
LAMC1-202ENST00000466964 MEMO1Q9Y316 297 aa9.9□□□□□ -0.82
LAMC1-202ENST00000466964 SPO11Q9Y5K1 396 aa9.9□□□□□ -0.82
LAMC1-202ENST00000466964 TLN2Q9Y4G6 2542 aa9.9□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 ADAM10O14672 748 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 FANCGO15287 622 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 OR2B3O76000 313 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 CD48P09326 243 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 DRD2P14416 443 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 SMSP52788 366 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 IST1P53990 364 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 CACNG1Q06432 222 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 TFF3Q07654 80 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 ZBTB17Q13105 803 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 PRKAA1Q13131 559 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 XRCC4Q13426 336 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 SLC9A5Q14940 896 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 SLC5A12Q1EHB4 618 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 TMEM220Q6QAJ8 160 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 SPESP1Q6UW49 350 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 LINC00696Q6ZRV3 163 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 OVCH1Q7RTY7 1134 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 GPR135Q8IZ08 494 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 FAF2Q96CS3 445 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 DMRTA2Q96SC8 542 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 MDFIQ99750 246 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 NDC1Q9BTX1 674 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 SEC14L3Q9UDX4 400 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 TINAGQ9UJW2 476 aa9.89□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 GSAPA4D1B5 854 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 OR2AG2A6NM03 316 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 HPP00738 406 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 NUDT7P0C024 238 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 TMPRSS15P98073 1019 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 MMRN1Q13201 1228 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 GTF2H3Q13889 308 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 BCL7AQ4VC05 210 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 GPRC6AQ5T6X5 926 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 ATG9BQ674R7 924 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 TLDC1Q6P9B6 456 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 NIPA2Q8N8Q9 360 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 NINJ1Q92982 152 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 OR2A14Q96R47 310 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 KLHL25Q9H0H3 589 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 OR52A5Q9H2C5 316 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 SRMSQ9H3Y6 488 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 IL17CQ9P0M4 197 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.88□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 ZANQ9Y493 2812 aa9.87□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa9.87□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 AGAP14A8MT82 685 aa9.87□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 UGT1A9O60656 530 aa9.87□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 CRYABP02511 175 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 PYGMP11217 842 aa9.87□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 UGT1A6P19224 532 aa9.87□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 UGT1A1P22309 533 aa9.87□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 UGT1A4P22310 534 aa9.87□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LAMC1-202ENST00000466964 DPYSL3Q14195 570 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms