RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TTC1Q99614 292 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SLC29A3Q9BZD2 475 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FAM83DQ9H4H8 585 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 EPHX3Q9H6B9 360 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CMTM6Q9NX76 183 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PKD2L2Q9NZM6 624 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FIS1Q9Y3D6 152 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CROCCQ5TZA2 2017 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PP18 115 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 FAM234BA2RU67 622 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ANTXRLA6NF34 631 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM202A6NGA9 273 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PRR19A6NJB7 356 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 HEPACAM2A8MVW5 462 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF33A8MVX0 844 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 C10orf142B7Z368 130 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MANBAO00462 879 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SNX2O60749 519 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 STK16O75716 305 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CSPG5O95196 566 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 NFATC1O95644 943 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 GSTM1P09488 218 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 OR56A5P0C7T3 313 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 EBLN1P0CF75 366 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ACPPP15309 386 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ITGB6P18564 788 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 JAK1P23458 1154 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 FSHRP23945 695 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PTPN6P29350 595 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 CTSCP53634 463 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 AP1S2P56377 157 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 GSTM4Q03013 218 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 HYAL1Q12794 435 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 BLMHQ13867 455 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 LDLRAP1Q5SW96 308 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 C6orf163Q5TEZ5 329 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TANGO2Q6ICL3 276 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ANO7Q6IWH7 933 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 LCN8Q6JVE9 175 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ZFP1Q6P2D0 407 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 VITQ6UXI7 678 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TMC5Q6UXY8 1006 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DLEU7Q6UYE1 221 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 TTC16Q8NEE8 873 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM125Q96AQ2 219 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 TIFAQ96CG3 184 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ZFYVE19Q96K21 471 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CDK15Q96Q40 435 aa5.52□□□□□ -1.53
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